Код по мкб туберкулез: Ошибка 404. Файл не найден

МКБ-10 код A19 | Милиарный туберкулез

ICD-10

ICD-10 is the 10th revision of the International Statistical Classification of Diseases and Related Health Problems (ICD), a medical classification list by the World Health Organization (WHO).

It contains codes for diseases, signs and symptoms, abnormal findings, complaints, social circumstances, and external causes of injury or diseases.

ATC

The Anatomical Therapeutic Chemical (ATC) Classification System is used for the classification of active ingredients of drugs according to the organ or system on which they act and their therapeutic, pharmacological and chemical properties.

It is controlled by the World Health Organization Collaborating Centre for Drug Statistics Methodology (WHOCC).

DDD

The defined daily dose (DDD) is a statistical measure of drug consumption, defined by the World Health Organization (WHO).

It is used to standardize the comparison of drug usage between different drugs or between different health care environments.

Класс I. Некоторые инфекционные и паразитарные болезни (A00-B99)

Материал опубликован 16 апреля 2015 в 13:07.
Обновлён 16 апреля 2015 в 13:07.

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 24 декабря 2012 г. № 1468н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при шигеллезе (дизентерии) легкой степени тяжести»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 14 февраля 2013 г. № 27096)

            Категория возрастная: дети
            Пол: любой
            Фаза: острая
            Стадия: легкая степень тяжести
            Осложнения: вне зависимости от осложнений
            Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
            Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
            Форма оказания медицинской помощи: неотложная
            Средние сроки лечения (количество дней): 25

            Код по МКБ X
            Нозологические единицы
                        А03.0 Шигеллез, вызванный Shigella dysenteriae
                        А03.1 Шигеллез, вызванный Shigella flexneri
                        А03.2 Шигеллез, вызванный Shigella boydii
                        А03.З Шигеллез, вызванный Shigella sonnei
                        А03.9 Шигеллез неуточненный

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 869н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при острых кишечных инфекциях и пищевых отравлениях легкой степени тяжести» 

 (Зарегистрировано в Минюсте России 14 марта 2013 г. № 27694)

            Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: острая
         Стадия: легкой степени тяжести
         Осложнения: вне зависимости от осложнений

         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: неотложная
         Средние сроки лечения (количество дней): 14
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                   А04.9 Бактериальная кишечная инфекция неуточненная
                   А05.0 Стафилококковое пищевое отравление
                   А05.2 Пищевое отравление, вызванное Clostridium perfringens
                   А05.3 Пищевое отравление, вызванное Vibrio parahaemolyticus
                   А05.4 Пищевое отравление, вызванное Bacillus cereus
                   А05.8 Другие уточненные бактериальные пищевые отравления
                   А05.9 Бактериальное пищевое отравление неуточненное
                   А09 Диарея и гастроэнтерит предположительно инфекционного происхождения

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 870н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при псевдотуберкулезе, иерсиниозе легкой степени тяжести»

 (Зарегистрировано в Минюсте РФ 27 февраля 2013 г. № 27356)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: острая
         Стадия: легкая степень тяжести
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 21
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                   А04.6 Энтерит, вызванный Yersinia enterocolitica
                   А04.8 Другие уточненные бактериальные кишечные инфекции

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 871н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при кампилобактериозе легкой степени тяжести»

 (Зарегистрировано в Минюсте РФ 23 января 2013 г. № 26687)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой Фаза: острая
         Стадия: легкая степень тяжести
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: неотложная
         Средние сроки лечения (количество дней): 21
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    А04.5 Энтерит, вызванный Campylobacter

 

Приказ Министерства здравоохранения  Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 744н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при туберкулезе костей и суставов»

 (Зарегистрировано в Минюсте России 21 февраля 2013 г., № 27252)

         Категория возрастная: взрослые
         Пол: любой
         Фаза: активная
         Стадия: любая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 365
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    А18.0 Туберкулез костей и суставов

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 797н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при коклюше легкой степени тяжести»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 19 февраля 2013 г., № 27196)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: острая
         Стадия: легкая степень тяжести
         Осложнения: без осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: неотложная
         Средние сроки лечения (количество дней): 14
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    A37.0 Коклюш, вызванный Bordetella pertussis
                    А37.1 Коклюш, вызванный Bordetella parapertussis
                    А37.9 Коклюш неуточненны

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 714н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при диарее и гастроэнтерите предположительно инфекционной этиологии легкой степени тяжести»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 15 февраля 2013 г., № 27122)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: профилактика кровотечений
         Стадия: любая
         Осложнения: без осложнений; у пациентов с ингибитором в анамнезе после успешной индукции иммунной толерантности или транзиторного ингибитора
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная медицинская помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 365
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    D66 Наследственный дефицит фактора VIII
                    D67 Наследственный дефицит фактора IX

 

 Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 725н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при преждевременном половом созревании, в том числе вторичного генеза»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 13 февраля 2013 г., № 27056)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: любая
         Стадия: хроническая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 365
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    D27 Доброкачественное новообразование яичника
                    D29 Доброкачественные новообразования мужских половых органов

                    D29.2 Яичка
                    D35 Доброкачественные новообразования других и неуточненных эндокринных желез<
                    D35.0 Надпочечника
                    Е03.9 Гипотиреоз неуточненный
                    Е22.8 Другие состояния гиперфункции гипофиза
                    Е22.9 Гиперфункция гипофиза неуточненная
                    Е25 Адреногенитальные расстройства
                    Е25.9 Андрогенитальное нарушение неуточненное
                    Е27.0 Другие виды гиперсекреции коры надпочечников
                    Е28.0 Избыток эстрогенов
                    Е29.0 Гиперфункция яичек
                    Е29.9 Дисфункция яичек неуточненная
                    Е30.1 Преждевременное половое созревание
                    Е30.8 Другие нарушения полового созревания
                    Е30.9 Нарушение полового созревания неуточненное
                    Q78.1 Полиостозная фиброзная дисплазия

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 9 ноября 2012 г. № 863н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при хронической надпочечниковой недостаточности»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 18 марта 2013 г., № 27732)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: хроническая
         Стадия: любая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 365
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                    А39.1+ Синдром Уотерхауса-Фридериксена (Е35.1)
                    Е23.0 Гипопитуитаризм
                    Е23.1 Медикаментозный гипопитуитаризм
                    Е27.1 Первичная недостаточность коры надпочечников
                    Е27.3 Медикаментозная недостаточность коры надпочечников
                    Е27.4 Другая и неуточненная недостаточность коры надпочечников
                    Е27.8 Другие уточненные нарушения надпочечников
                    Е27.9 Болезнь надпочечников неуточненная
                    Е31.0 Аутоиммунная полигландулярная недостаточность
                    Е71.3 Нарушения обмена жирных кислот
                    Е89.6Гипофункция коры надпочечников (мозгового слоя), возникшая после медицинских процедур

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 24 декабря 2012 г. № 1496н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при остром некротическом язвенном гингивите»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 20 февраля 2013 г., № 27235)

         Категория возрастная: взрослые
         Пол: любой
         Фаза: острая
         Стадия: любая
         Осложнения: без осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: неотложная
         Средние сроки лечения (количество дней): 14
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                   А69.1 Другие инфекции Венсана

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 24 декабря 2012 г. № 1511н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при болезни, вызванной вирусом иммунодефицита человека (ВИЧ-инфекцией)»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 13 февраля 2013 г., № 27053)

         Категория возрастная: взрослые
         Пол: любой
         Фаза: любая
         Стадия: любая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная медицинская помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 365
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы                    
В20 Болезнь, вызванная вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ], проявляющаяся в виде инфекционных и паразитарных болезней
В21 Болезнь, вызванная вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ], проявляющаяся в виде злокачественных новообразований
В22 Болезнь, вызванная вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ], проявляющаяся в виде других уточненных болезней
В23 Болезнь, вызванная вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ], проявляющаяся в виде других состоянийВ24 Болезнь, вызванная вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ], неуточненная
Z21 Бессимптомный инфекционный статус, вызванный вирусом иммунодефицита человека [ВИЧ]

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 28 декабря 2012 г. № 1617н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при контагиозном моллюске»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 25 февраля 2013 г., № 27295)

         Категория возрастная: взрослые, дети
         Пол: любой
         Фаза: любая
         Стадия: любая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 3
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                   В08.1 Контагиозный моллюск

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 28 декабря 2012 г. № 1579н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи детям при инфекции, вызванной вирусом простого герпеса (herpes simplex)»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 21 марта 2013 г., № 27818)

         Категория возрастная: дети
         Пол: любой
         Фаза: острая
         Стадия: легкой степени тяжести
         Осложнения: без осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: неотложная
         Средние сроки лечения (количество дней): 7
         Код по МКБ Х
         Нозологические единицы
                   В00.1 Герпетический везикулярный дерматит
                   В00.2 Герпетический гингивостоматит и фаринготонзиллит

 

Приказ Министерства здравоохранения Российской Федерации от 28 декабря 2012 г. № 1586н «Об утверждении стандарта первичной медико-санитарной помощи при кандидозе кожи и ногтей»

(Зарегистрировано в Минюсте РФ 14 февраля 2013 г., № 27077)

         Категория возрастная: взрослые
         Пол: любой
         Фаза: любая
         Стадия: любая
         Осложнения: вне зависимости от осложнений
         Вид медицинской помощи: первичная медико-санитарная помощь
         Условия оказания медицинской помощи: амбулаторно
         Форма оказания медицинской помощи: плановая
         Средние сроки лечения (количество дней): 90
         Код по МКБ X
         Нозологические единицы
                   В37.2 Кандидоз кожи и ногтей

 

Категории: приказ; стандарты; МКБ X.

Медицинские показания и противопоказания для поступления в санаторий

18 декабря 2020

Перечень медицинских показаний для санаторно-курортного лечения детского населения

I. Медицинские показания для санаторно-курортного лечения детского населения при заболевании туберкулезом
(I класс по МКБ-10 1)

N п/п	Код заболевания по МКБ-10	Наименование заболевания	Форма, стадия, фаза, степень тяжести заболевания	Курорты, санаторно-курортные организации
1.	A15	Туберкулез органов дыхания, подтвержденный бактериологически и гистологически	Активный туберкулез после прекращения бактериовыделения в результате проведения интенсивной фазы химиотерапии, при отсутствии или с наличием лекарственной устойчивости возбудителя, при отсутствии или с наличием осложнений туберкулеза, при отсутствии или с наличием сопутствующих заболеваний, в том числе после хирургического лечения	Специализированные санаторно-курортные организации. Климатические курорты
	A17+	Туберкулез нервной системы
	A19	Милиарный туберкулез
2.	A16	Туберкулез органов дыхания, не подтвержденный бактериологически или гистологически	Активный туберкулез при отсутствии или с наличием осложнения туберкулеза, при отсутствии или с наличием сопутствующих заболеваний после окончания интенсивной фазы химиотерапии. Клинически излеченный туберкулез	Специализированные санаторно-курортные организации. Климатические курорты
	B90	Последствия туберкулеза
3.	R76.1	Аномальная реакция на туберкулиновую пробу	Риск развития активного туберкулеза у детей из групп риска по туберкулезу	Специализированные санаторно-курортные организации. Климатические курорты
	Z20.1	Контакт с больным или возможность заражения туберкулезом
4.	A18	Туберкулез других органов	Активный туберкулез любых органов и систем, кроме туберкулеза органов дыхания, нервной системы и милиарного туберкулеза, осложнения после введения вакцины против туберкулеза при отсутствии или с наличием осложнения туберкулеза, при отсутствии или с наличием сопутствующих заболеваний после окончания интенсивной фазы химиотерапии. Клинически излеченный туберкулез	Специализированные санаторно-курортные организации. Климатические курорты

 

Перечень медицинских противопоказаний для санаторно-курортного лечения

1. Заболевания в острой и подострой стадии, в том числе острые инфекционные заболевания до окончания периода изоляции.

2. Заболевания, передающиеся половым путем.

3. Хронические заболевания в стадии обострения.

4. Бактерионосительство инфекционных заболеваний.

5. Заразные болезни глаз и кожи.

6. Паразитарные заболевания.

7. Заболевания, сопровождающиеся стойким болевым синдромом, требующим постоянного приема наркотических средств и психотропных веществ, включенных в списки I и II Перечня наркотических средств, психотропных веществ и их прекурсоров, подлежащих контролю в Российской Федерации 1, зарегистрированных в качестве лекарственных препаратов.

8. Туберкулез любой локализации в активной стадии (для санаторно-курортных организаций нетуберкулезного профиля).

9. Новообразования неуточненного характера (при отсутствии письменного подтверждения в медицинской документации пациента о том, что пациент (законный представитель пациента) предупрежден о возможных рисках, связанных с осложнениями заболевания в связи с санаторно-курортным лечением).

10. Злокачественные новообразования, требующие противоопухолевого лечения, в том числе проведения химиотерапии.

11. Эпилепсия с текущими приступами, в том числе резистентная к проводимому лечению.

12. Эпилепсия с ремиссией менее 6 месяцев (для санаторно-курортных организаций не психоневрологического профиля).

13. Психические расстройства и расстройства поведения в состоянии обострения или нестойкой ремиссии, в том числе представляющие опасность для пациента и окружающих.

14. Психические расстройства и расстройства поведения, вызванные употреблением психоактивных веществ.

15. Кахексия любого происхождения.

16. Неизлечимые прогрессирующие заболевания и состояния, требующие оказания паллиативной медицинской помощи.

 

Предлагается расширить перечень заболеваний, препятствующих помещению в СИЗО

Одна из экспертов отметила, что предлагаемый проект – долгожданное и эффективное решение существующей проблемы, способное обеспечить равенство прав подозреваемых и обвиняемых лиц с лицами, уже отбывающими наказание. Другая указала, что несмотря на теоретическую значимость поправок сложно предугадать, будут ли они успешно работать на практике.

25 октября Минюст России вынес на общественное обсуждение проект постановления Правительства РФ о внесении изменений в Перечень тяжелых заболеваний, препятствующих содержанию под стражей подозреваемых или обвиняемых в совершении преступлений.

Читайте также

Утверждена концепция развития уголовно-исполнительной системы России до 2030 г.

В документе подведены итоги деятельности УИС за 10 лет и перечислен ряд основных ориентиров ее развития до 2030 г.

18 Мая 2021

Согласно поправкам будет утвержден новый перечень тяжелых заболеваний, приведенный в соответствие с Международной классификацией болезней МКБ-10, который будет дополнять и конкретизировать утвержденный Постановлением Правительства РФ от 14 января 2011 г. № 3 «О медицинском освидетельствовании подозреваемых или обвиняемых в совершении преступлений».

В частности, предлагается, что перечень будет включать в себя расширенный список инфекционных болезней, среди которых помимо туберкулеза органов дыхания будут и иные виды туберкулеза. В перечень заболеваний будут входить различные формы злокачественных новообразований, все случаи новообразований, требующие лечения в специализированной медицинской организации (хирургического лечения, лучевой и противоопухолевой лекарственной терапии), которое не может быть проведено в месте содержания под стражей, а также лимфомы и лейкоз.

Планируется расширить список заболеваний крови, эндокринной системы, расстройства питания и нарушения обмена веществ, системы кровообращения, органов дыхания, пищеварения и мочеполовой системы. К болезням нервной системы добавятся болезнь Паркинсона, эпилепсия и др. К заболеваниям глаз планируется относить не только полную слепоту, но и выраженное снижение остроты зрения на почве стойких патологических изменений.

Впервые появятся в данном перечне болезни кожи и подкожной клетчатки, костно-мышечной системы и соединительной ткани, врожденные пороки развития, а также заболевания (состояния), требующие оказания паллиативной медицинской помощи. Согласно изменениям к заболеваниям, препятствующим содержанию под стражей, будут относиться и болезни, связанные с беременностью, родами и послеродовым периодом.

В пояснительной записке отмечается, что проект постановления направлен на гуманизацию законодательства при применении меры пресечения в виде заключения под стражу. «Необходимость корректировки перечня заболеваний обусловлена обращениями граждан и общественных организаций, а также результатами анализа правоприменения законодательства РФ ‎в сфере охраны здоровья лиц, находящихся в местах содержания под стражей, свидетельствующими о несоответствии ряда заболеваний и степени функциональных нарушений тяжести состояния пациента», – указано в пояснительной записке.

Адвокат АП Иркутской области Мария Глухова считает, что предлагаемые изменения – это долгожданное и эффективное решение существующей проблемы. По ее мнению, действующий перечень таких заболеваний не отвечает принципу правовой определенности, поскольку не содержит четких наименований заболеваний и медицинских критериев состояния больного органа, как следствие, это нарушает право подозреваемого или обвиняемого на своевременное освобождение из-под стражи в связи с наличием тяжелого заболевания до наступления тяжких последствий.

Мария Глухова отметила, что новый перечень более конкретизирован, заболевания обозначены в соответствии с Международной классификацией болезней, способен обеспечить равенство прав подозреваемых и обвиняемых лиц с лицами, уже отбывающими наказание. Так, эксперт подчеркнула: к примеру, в отношении отбывающих наказание граждан, у которых наступило психическое расстройство или иная тяжелая болезнь, действует «свой» перечень заболеваний, препятствующих отбыванию наказания, утвержденный Постановлением Правительства РФ № 54 от 6 февраля 2004 г. Такой перечень помимо четкого наименования заболевания содержит код по МКБ, является более ясным и определенным нормативным правовым актом, удобным для понимания и применения, заметила Мария Глухова.

«Права же подозреваемых и обвиняемых в совершении преступлений лиц ущемлены действующим перечнем тяжелых заболеваний ввиду его неоднозначного толкования», – полагает эксперт. По мнению Марии Глуховой, с корректировкой перечня заболеваний процедура освидетельствования подозреваемых или обвиняемых в совершении преступлений станет более прозрачной и понятной, не позволит трактовать состояние здоровья лица по усмотрению врачебной комиссии, исключит субъективный фактор и, возможно, коррупционную составляющую. «Предлагаемые изменения в законодательстве положительным образом повлияют на права лиц, имеющих тяжелые заболевания, в отношении которых применяется заключение под стражу», – резюмировала эксперт.

Юрист Благотворительного фонда помощи осужденным и их семьям «Русь Сидящая» (внесен в реестр НКО, выполняющих функции иностранного агента. – Прим. ред.) Ева Корнейчик отметила, что в октябре прошлого года уполномоченный по правам предпринимателей Борис Титов направил в Верховный Суд свои предложения по расширению перечня заболеваний, которые препятствуют содержанию подозреваемых и обвиняемых в СИЗО. По мнению эксперта, в проекте постановления Минюста эти требования были частично учтены: в предлагаемом перечне содержатся онкологические заболевания, туберкулез, диабет, ВИЧ и болезни, требующие оказания паллиативной помощи. «Безусловно, такой гуманистический подход со стороны законодателя можно оценивать только положительно. Однако несмотря на теоретическую значимость поправок сложно предугадать, будут ли они так же хорошо работать на практике», – прокомментировала Ева Корнейчик.

Эксперт обратила внимание, что проблема освобождения лиц, даже с тяжелыми заболеваниями из ныне действующего перечня, остро стоит на сегодняшний день – для этого приходится прилагать неимоверные усилия, и зачастую их отпускают лишь в настолько больном состоянии, что они через пару дней погибают дома. Конечно, расширение существующего списка – это хороший шаг, но проблема правоприменительной практики остается, добавила Ева Корнейчик. «Помимо формальных поправок, конечно, необходима и корректировка деятельности правоприменителя – необходимо, чтобы сейчас должным образом исполнялись требования “старых” и менее гуманных законов, чтобы и в будущем суды восприняли обновленный перечень заболеваний как обязательное “руководство к действию”», – заключила эксперт.

Пневматоз кишечника — причины, симптомы, диагностика и лечение

Пневматоз кишечника — патологический процесс, при котором в кишечной стенке формируются воздушные кисты. Заболевание проявляется схваткообразной разлитой болью и чувством распирания в животе. Возникает расстройство стула, тошнота, отрыжка, рвота. Диагностические мероприятия включают в себя осмотр гастроэнтеролога, проведение обзорной рентгенографии брюшной полости, ирригоскопии, колоноскопии. В зависимости от преобладающих симптомов при пневматозе назначают ветрогонные, спазмолитические, слабительные или противодиарейные препараты, диетическое питание с пониженным употреблением газообразующих продуктов.

Общие сведения

Пневматоз кишечника – редкое заболевание ЖКТ, при котором кишечные газы проникают в толщу стенки органа и образуют в ней воздушные полости. Чаще патологический процесс локализуется в подслизистом или субсерозном слое толстой или тощей кишки. Заболевание может поражать людей всех возрастов, но преимущественно встречается у младенцев и пожилых людей ввиду пониженной физической активности и частых нарушений в работе пищеварительной системы. Размеры воздушных кист могут варьировать от 0,5 до 5 см в диаметре. По распространенности процесса пневматоз разделяют на ограниченный, затрагивающий одну область кишечника, и диффузный. Последний характеризуется равномерным распространением патологических образований по всей площади кишечного тракта.

Пневматоз кишечника

Причины

Заболевание редко является самостоятельной патологией, чаще возникает на фоне первичного поражения ЖКТ. Основной причиной пневматоза является избыточное образование и длительное нахождение газов в кишечнике, возникающее в результате следующих состояний:

• Кишечные инфекции. При тяжелые инфекционных поражениях кишечника (дизентерия, холера, сальмонеллёз, пищевые токсикоинфекции) повышенное газообразование является следствием процесса брожения и выделения газообразных веществ патогенными микроорганизмами.
• Опухоли ЖКТ. В результате злокачественных и доброкачественных новообразований кишечника возникает сужение или закупорка его просвета, что приводит к кишечной непроходимости, избыточному скоплению газов и их проникновению внутрь кишечной стенки.
• Другие заболевания пищеварительного тракта. Атония, воспалительные заболевания кишечника (колит, энтероколит, болезнь Крона), наличие спаек между петлями органа способствуют нарушению утилизации образовавшегося газа и формированию пневматоза.
• Нездоровый образ жизни. Адинамия, нервные расстройства, потребление избыточного количества продуктов, вызывающих газообразование (капуста, хлеб и др.), могут приводить к нарушению пищеварения, метеоризму и формированию воздушных полостей в кишечной стенке.

Патогенез

Механизм образования патологических кист до конца не изучен. На сегодняшний день существует три теории формирования кишечного пневматоза: легочная, инфекционная и механическая. Согласно легочной теории, пневматоз возникает вследствие хронических заболеваний легких (бронхиальная астма, ХОБЛ). В результате постоянного кашля происходят микронадрывы альвеол, возникает пневмомедиастинум, который приводит к распространению воздуха в забрюшинное пространство. Оттуда свободный газ диффундирует в кишечную стенку и накапливается под серозной оболочкой. В соответствии с инфекционной теорией происхождения болезни, газы, которые выделяют бактерии, проникают в воспаленную стенку кишки и могут сливаться с образованием больших пузырей.

В гастроэнтерологии наибольшее признание получила механическая теория пневматоза. Согласно данной концепции, воздушные кисты кишечника возникают при первичной патологии ЖКТ (опухоль, энтероколит, стеноз) и врожденных дефектах кровеносных и лимфатических сосудов кишки. На фоне заболеваний ЖКТ происходит травматизация и истончение внутренней оболочки кишки. Газ под воздействием внутрикишечного давления проходит через микродефекты, попадает в подслизистые лимфатические сосуды и распространяется с помощью перистальтики в подслизистом слое кишечника. Кисты изнутри выстланы эпителием и могут содержать различные газы: азот, кислород, водород, аргон, двуокись углерода и др.

КТ ОБП. Включения газа в стенке сигмовидной кишки на фоне долихосигмы.

Симптомы пневматоза кишечника

Клиническая картина болезни зависит от степени распространения и количества газовых полостей. Пациенты предъявляют жалобы на чувство дискомфорта и тяжести в животе, нарушение отхождения газов (метеоризм). Появляются периодические схваткообразные абдоминальные боли без четкой локализации. Формирование воздушных кист приводит к замедлению перистальтики и возникновению запоров. Отсутствие стула сменяется диареей с примесью слизи. Возникает тошнота и рвота, отрыжка с неприятным запахом. Диффузное распространение пневматоза приводит к ухудшению общего состояния пациента: отмечается бледность кожных покровов, нарастает слабость, снижается АД, компенсаторно повышается ЧСС.

Осложнения

Увеличение внутрикишечного давления способствует изменению формы петель кишечника с формированием заворота или инвагинации. Рост количества пузырей или увеличение их размеров приводит к полной или частичной закупорке просвета органа с развитием обтурационной кишечной непроходимости. Обтурация сопровождается общей интоксикацией организма, что может привести к инфекционно-токсическому шоку и летальному исходу. Разрастание полостей способствует образованию кишечных спаек. Давление на стенку кишки приводит к нарушению ее питания, развитию ишемии и некроза. Омертвление участков органа и избыточное давление газов может вызывать разрывы кишечной стенки и проникновение содержимого кишки в брюшную полость. В этом случае возникает перитонит, а при отсутствии экстренных мероприятий — сепсис.

Диагностика

При ограниченном пневматозе кишечника ввиду отсутствия выраженной специфической симптоматики диагностика затруднительна. При возникновении болей, нарушении процесса пищеварения пациентам необходима консультация гастроэнтеролога. Специалист проводит комплексный осмотр, изучает анамнез заболевания и сопутствующую патологию, обращая особое внимание на болезни ЖКТ. В некоторых случаях при глубокой пальпации живота удается прощупать небольшие округлые образования, идущие вереницей вдоль кишечного тракта, напоминая гроздь винограда. Для установления диагноза проводятся следующие исследования:

1. Обзорная рентгенография брюшной полости. Позволяет определить газовые пузыри различных размеров, расположенные цепочкой. Для пневматоза характерно наличие двойных кольцевидных теней в раздутых кишечных петлях.
2. Ирригоскопия. При помощи данного метода определяется избыточный газ в увеличенных петлях толстого кишечника в виде нескольких близко расположенных округлых теней, разделенных стенкой. В ходе исследования можно обнаружить участки сужения просвета, патологические новообразования, изъязвления кишечной трубки.
3. Колоноскопия. Эндоскопическое исследование позволяет визуализировать газовые пузырьки, оценить масштабы поражения и состояние слизистой оболочки ЖКТ. При необходимости эндоскопист проводит биопсию участка кишки для гистологического анализа.

Дифференциальная диагностика пневматоза проводится с неспецифическим колитом, пневмоперитонеумом, дивертикулами и дупликатурой кишечника. При полной обтурации исключают кишечную непроходимость другой этиологии.

КТ ОБП. Пневматоз стенки сигмовидной кишки (этот же пациент).

Лечение пневматоза кишечника

Исходя из того, что патология развивается вторично, на фоне других заболеваний ЖКТ, в первую очередь необходимо устранить первопричину болезни. Тактика лечения пневматоза направлена на уменьшение вздутия живота и облегчение выхода газов естественным путем. Ввиду того, что после резекции пораженного участка кишки возникают частые рецидивы болезни, хирургическое удаление пузырей применяется крайне редко. Лечение заболевания проводится по следующим направлениям:

• Медикаментозная терапия. Включает назначение препаратов на основе фенхеля и симетикона, которые устраняют симптомы метеоризма. При боли и спазмах в животе применяют спазмолитики, при запоре — слабительные, при диарее — противодиарейные препараты. При замедлении перистальтики назначают прокинетки. Инфекционная природа болезни может потребовать использования антибактериальных препаратов.
• Диета. Грамотный рацион при пневматозе должен состоять из нежирной, свежей пищи. Рекомендовано употреблять супы, каши, постные виды птицы и рыбы. Из напитков следует отдать предпочтение морсу, некрепкому чаю, киселю. Блюда следует употреблять небольшими порциями 4-5 раз в сутки в свежем, вареном и тушеном виде. Необходимо исключить продукты, вызывающие повышенное газообразование: бобы, помидоры, капусту, яблоки, жаренную и копченую пищу, консервы, сладкую выпечку, хлебобулочные изделия, газированные напитки. Следует отказаться от употребления алкоголя.

Дополнительным методом лечения пневматоза является гипербарическая оксигенация (ГБО). В результате активного насыщения крови кислородом происходит снижение общего давления газов венозной крови, что может способствовать рассасыванию газовых пузырей. Оперативные методы лечения применяются при развитии осложнений (кишечной непроходимости, перитоните, инвагинации кишечника и др.).

Прогноз и профилактика

При устранении первичного заболевания, проведении лечебных мероприятий и соблюдении диеты прогноз благоприятный. Образование больших или/и множественных газовых кист увеличивает риск развития осложнений (перитонит, кишечная непроходимость) и значительно ухудшает прогноз болезни. Профилактика пневматоза кишечника включает своевременную диагностику и лечение заболеваний ЖКТ, употребление в пищу свежей и качественной пищи. При наличии хронической патологи со стороны пищеварительной системы рекомендовано 1-2 раза в год проходить плановое УЗИ брюшной полости.

Туберкулезные инфекции — Определения, коды МКБ 10 и коды МКБ 11

Заболевание, вызванное инфекцией, вызываемой бактериями комплекса Mycobacterium tuberculosis. Это заболевание проявляется симптомами в зависимости от места заражения. Передача обычно происходит при вдыхании инфицированных респираторных выделений.

Туберкулез дыхательной системы

Определение туберкулеза дыхательной системы: это прогрессирующее или хроническое заболевание, возникающее в результате инфицирования бактериями Mycobacterium tuberculosis или бактериями M.комплекс туберкулеза: M. bovis, M. africanum, M. canetti и M. microti. Инфекция ограничивается дыхательной системой.

Кодекс по туберкулезу органов дыхания по МКБ 11

1B10 Туберкулез органов дыхания

1B10.0 Подтвержденный туберкулез органов дыхания

Определение туберкулеза органов дыхания подтверждено: туберкулез органов дыхания , вызванный инфекцией, вызываемой бактериями Mycobacterium tuberculosis, что подтверждено лабораторными исследованиями.Это заболевание характеризуется хроническим кашлем и выделением мокроты, которая может иметь геморрагический характер. Передача обычно происходит при вдыхании инфицированных респираторных выделений. Подтверждением является идентификация Mycobacterium tuberculosis в клинических образцах.

1B10.1 Туберкулез органов дыхания, не подтвержден

Определение туберкулеза органов дыхания, не подтверждено: заболевание дыхательных путей, вызванное инфекцией, вызываемой бактериями Mycobacterium tuberculosis, не подтвержденное.Это заболевание характеризуется хроническим кашлем и выделением мокроты, которая может иметь геморрагический характер. Передача обычно происходит при вдыхании инфицированных респираторных выделений.

1B10.Z Туберкулез органов дыхания, без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

Кодекс МКБ 10 для туберкулеза дыхательной системы

A15 Туберкулез органов дыхания, подтвержденный бактериологически и гистологически 2

2

0 Туберкулез легких, подтвержденный микроскопией мокроты с посевом или без посева

Туберкулез легкого, подтвержденный бактериологически

Туберкулезный:

• бронхоэктаз подтвержден бактериологически с посевом или без посева
• Фиброз легких подтвержден бактериологически с посевом или без него
• пневмония подтверждена бактериологически с посевом или без посева
• пневмоторакс подтверждена бактериологически с посевом или без него

Исключения:

• Подтверждено только посевом

A15.1 Туберкулез легких, подтвержденный только посевом

• Состояния, перечисленные в A15.0, подтвержденные только посевом

A15.2 Туберкулез легких, подтвержденный гистологически

• Состояния, перечисленные в A15.0 , подтверждено гистологически

A15.3 Туберкулез легких, подтвержденный неуточненными средствами

• Состояния, перечисленные в A15.0, подтвержденные, но неуточненные бактериологически или гистологически

A15.4 Туберкулез внутригрудных лимфатических узлов, подтвержденный бактериологически и гистологически

Туберкулез лимфатических узлов:

• внутриутробный подтвержденный бактериологически и гистологически
• средостенный подтвержденный бактериологически и гистологически
• трахеобронхиальный подтвержденный 8

  A15.5 Туберкулез гортани, трахеи и бронхов, подтвержденный бактериологически и гистологически

  Туберкулез:

  • бронхов подтвержден бактериологически и гистологически
  • голосовой щели подтвержден бактериологически и гистологически
  • гортани 57 подтвержден бактериологически и гистологически
  • гортани 57 подтвержден подтверждено бактериологически и гистологически

  A15.6 Туберкулезный плеврит, подтвержденный бактериологически и гистологически

  Туберкулез:

  • Туберкулез плевры подтвержден бактериологически и гистологически
  • Туберкулезная эмпиема подтверждена бактериологически и гистологически

  Исключения:

  инклюзии дыхательных путей
  и гистологически

  A15.7 Первичный туберкулез органов дыхания, подтвержденный бактериологически и гистологически

  A15.8 Другой туберкулез органов дыхания, подтвержденный бактериологически и гистологически

  • Туберкулез средостения
  • Туберкулез носоглотки
  • Туберкулез носа (подтвержденный бактериологически и гистологически)
  • Туберкулез носовых пазух2

    0 и бактериологически 9

    A15.9 Туберкулез органов дыхания неуточненный, подтвержденный бактериологически и гистологически

    A16 Туберкулез органов дыхания, не подтвержденный бактериологически или гистологически

    A16.0 Туберкулез легкого, бактериологически и гистологически отрицательный

    Туберкулезный:

    • бронхоэктазный бактериологически и гистологически отрицательный
    • бактериологически и гистологически отрицательный фиброз легкого
    • бактериологически и гистологически отрицательный
    • пневмония бактериологически и гистологически отрицательный
    • бактериологически и гистологически отрицательный

      02

    • A16.1 Туберкулез легких, бактериологическое и гистологическое исследование не проводилось
      • Состояния, перечисленные в A16.0, бактериологическое и гистологическое исследование не проводилось

      A16.2 Туберкулез легкого без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

      • Туберкулез легкого
      • Туберкулезный бронхоэктаз БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • фиброз легких БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • пневмония БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • пневмоторакс БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)

      A16.3 Туберкулез внутригрудных лимфатических узлов, без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения

      Туберкулез лимфатических узлов:

      • внутригрудных БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • внутригрудного БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • средостенная БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • трахеобронхиальная БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)

      Исключения:

      • При указании первичной

      A16.4 Туберкулез гортани, трахеи и бронхов, без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения

      Туберкулез:

      • бронхов БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • голосовой щели БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • голосовой щели БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • трахеи БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)

      A16.5 Туберкулезный плеврит, без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения

      • Туберкулез плевры БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • Туберкулезная эмпиема БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • Туберкулезный плеврит БДУ (без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении) упоминание о бактериологическом или гистологическом подтверждении)

      Исключения:

      • При первичном туберкулезе органов дыхания

      A16.7 Первичный туберкулез органов дыхания без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

      Первичный:

      • Туберкулез органов дыхания БДУ
      • туберкулезный комплекс

      A16.8 Другой туберкулез органов дыхания без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

      • Туберкулез средостения БДУ (без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении)
      • Туберкулез носоглотки БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • Туберкулез носа БДУ (без упоминания бактериологического или гистологического подтверждения)
      • Туберкулез носовой пазухи [любой ] БДУ (без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении)

      A16.9 Туберкулез органов дыхания неуточненный, без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

      • Туберкулез органов дыхания NOS
      • Туберкулез NOS

      Туберкулез нервной системы

      Определение туберкулеза центральной нервной системы: заболевание центральной нервной системы. вызвано инфекцией, вызываемой бактериями Mycobacterium tuberculosis. Это заболевание характеризуется неврологическим дефицитом в зависимости от пораженного участка.Передается гематогенным путем в нервную систему после вдыхания инфицированных выделений из дыхательных путей. Подтверждением является идентификация Mycobacterium tuberculosis в спинномозговой жидкости.

      Кодекс туберкулеза нервной системы по МКБ 11

      1B11 Туберкулез нервной системы

      1B11.0 Туберкулезный менингит
      
      Определение туберкулезного менингита: заболевание, вызванное мозговыми оболочками. заражением бактериями Mycobacterium tuberculosis.Это заболевание характеризуется лихорадкой, головной болью или неврологическим дефицитом. Передается гематогенным путем в мозговые оболочки после вдыхания инфицированных выделений из дыхательных путей. Подтверждением является идентификация Mycobacterium tuberculosis в спинномозговой жидкости.

      Включения:

      • Туберкулезный лептоменингит

      1B11.1 Туберкулезный менингоэнцефалит

      1B11.2 Менингеальная туберкулема
      Meberculrate
      eal туберкулема в пределах Менингеальной туберкуломы
      Meberculrate
      eal туберкуломы в пределах Менингеального туберкулеза. вещество головного мозга, вызванное распространением туберкулеза в центральную нервную систему.

      Включения:

      1B11.3 Туберкулезная гранулема головного мозга

      1B11.4 Туберкулезная гранулема мозговых оболочек

      1B11.Y Туберкулез другой уточненной части мозга

      1B11.Z Туберкулез нервной системы неуточненный

      Код МКБ 10 для туберкулеза нервной системы

      A17 Туберкулез нервной системы

      A17.0 Туберкулезный менингит

      • Туберкулез мозговых оболочек (церебральный) (спинной)
      • Туберкулезный лептоменингит

      A17.1 Менингеальная туберкулема

      A17.8 Другая нервная система

      Туберкулома головного мозга
      • Туберкулема спинного мозга
      • Туберкулез головного мозга
      • Туберкулез спинного мозга

      Туберкулезный:

      • абсцесс головного мозга
      • менингоэнцефалит
      • миелит
      • полинейропатия 5119 Туберкулез нервной системы неуточненный

        Туберкулез других систем и органов

        МКБ 11 Кодекс для туберкулеза других систем и органов

        1B12 Туберкулез других систем и органов

        1B12.0 Туберкулез сердца
        
        Определение туберкулеза сердца: Инфекция Mycobacterium tuberculosis, поражающая сердце и перикард

        1B12.1 Туберкулез глаза
        
        Определение туберкулеза глаза: Туберкулез глаза. Это может проявляться по-разному, включая кератоконъюнктивит, эписклерит, передний увеит и задний увеит

        Исключения:

        1B12.2 Туберкулез уха
        
        Определение туберкулеза уха: и во многих случаях смертельное инфекционное заболевание, вызываемое различными штаммами микобактерий, обычно Mycobacterium tuberculosis.Это диагноз уха.

        Исключения:

        • Туберкулез кожи наружного уха
        • Туберкулезный мастоидит

        1B12.3 Туберкулез эндокринных желез
        
        Определение туберкулеза эндокринных желез: Инфекция микобактерий желез внутренней секреции. результирующие эндокринные нарушения, включая недостаточность надпочечников или гипофиза.

        Кодируется в другом месте:

        • Туберкулезная болезнь Аддисона

        1B12.4 Туберкулез опорно-двигательного аппарата
        
        Другой код:

        • Микобактериальная инфекция позвонка

        1B12.40 Туберкулез костей или суставов
        
        Определение костей или суставов : Заболевание костей и суставов, вызванное бактериальной инфекцией Mycobacterium tuberculosis. Это заболевание обычно проявляется болью в костях, воспалением суставов, потерей подвижности или чувствительности пораженной кости или сустава, а также слабыми костями, склонными к переломам.Передается гематогенным путем к костям и суставам после вдыхания инфицированных выделений из дыхательных путей. Подтверждением является идентификация Mycobacterium tuberculosis в образцах биопсии пораженного участка.

        1B12.41 Туберкулезный миозит

        1B12.4Y Туберкулез другой уточненной части опорно-двигательного аппарата

        1B12.4Z Туберкулез опорно-двигательного аппарата

        03000314

        .5 Туберкулез мочеполовой системы
        
        Определение туберкулеза мочеполовой системы: Туберкулез мочевыводящих путей и / или репродуктивных органов. Первичным очагом инфекции чаще всего являются почки в результате гематогенного распространения из отдаленных мест: инфекция может распространяться дальше по мочевыводящим путям и / или репродуктивным органам. Генитальная инфекция может передаваться половым путем.

        1B12.6 Туберкулезная периферическая лимфаденопатия
        
        Определение туберкулезной периферической лимфаденопатии: заболевание периферических лимфатических узлов, вызванное инфекцией, вызываемой бактериями Mycobacterium tuberculosis.Это заболевание характеризуется воспалением периферических лимфатических узлов, обычно шейных лимфатических узлов. Передается гематогенным путем в периферические лимфатические узлы после вдыхания инфицированных выделений из дыхательных путей. Подтверждением является идентификация Mycobacterium tuberculosis в биоптатах лимфатических узлов.

        Включения:

        Исключения:

        • Туберкулез внутригрудных лимфатических узлов, подтвержденный бактериологически или гистологически
        • Туберкулез внутригрудных лимфатических узлов, без упоминания о бактериологическом или гистологическом подтверждении

      7 Туберкулез пищеварительной системы
      
      Определение туберкулеза пищеварительной системы: Туберкулез пищеварительного тракта или гепатобилиарной системы

      1B12.8 Туберкулез кожи
      
      Определение туберкулеза кожи с поражением туберкулеза кожи: туберкулез кожи и слизистые оболочки, включая обыкновенную волчанку, скрофулодермию и периорифциальный туберкулез.

      Исключения:

      • Туберкулиды
      • Кожные осложнения иммунизации БЦЖ

      Кодируется в другом месте:

      • Острый милиарный кожный туберкулез

      1B12.Y Туберкулез другого указанного органа или участка

      Код МКБ 10 для туберкулеза других систем и органов

      A18 Туберкулез других органов

      A18.0 Туберкулез костей и суставов

      Туберкулез из:

      Туберкулезный:

      • артрит
      • мастоидит
      • некроз костей
      • остеит
      • остеомиелит
      • синовит
      • теносиновит

      A18.1 Туберкулез мочеполовой системы

      Туберкулез:

      • мочевого пузыря
      • шейки матки
      • почки
      • мужских половых органов
      • мочеточника

      Туберкулезное 13 воспалительное заболевание женских органов малого таза

      A18 Туберкулезное заболевание периферических органов.

      Исключения:

      Туберкулез лимфатических узлов:

      • внутригрудной
      • мезентериальный и забрюшинный

      Туберкулезная трахеобронхиальная аденопатия

      A18.3 Туберкулез кишечника, брюшины и брыжеечных желез

      Туберкулез (из):

      • ануса и прямой кишки
      • кишечник (толстый) (тонкий)
      • забрюшинный (лимфатические узлы)

      Туберкулезный асцит

      • энтерит
      • перитонити

      A18.4 Туберкулез кожи и подкожной клетчатки

      Индуративная эритема, туберкулезная волчанка:

      • exedens
      • vulgaris:
        — БДУ
        3

      — области век Исключения :
      • красная волчанка
      • красная волчанка

      A18.5 Туберкулез глаза

      Туберкулезный:

      • хориоретинит
      • эписклерит
      • интерстициальный кератит
      • иридоциклит
      • кератоконъюнктивит (интерстициальный) (фликтенулярный 12

        Исключение 9000: 9112

        Исключения .:

        A18.7 Туберкулез надпочечников

        • Болезнь Аддисона, туберкулезная

        A18.8 Туберкулез других уточненных органов

        Туберкулез:

        • эндокард
        • миокард
        • пищевод
        • перикард
        • щитовидная железа

        Туберкулезный церебральный артериит

        Милиарный туберкулезный церебральный артериит

        Милиарный туберкулез церебрального артериита

        Милиарный туберкулез церебрального артериита

        1B13 Милиарный туберкулез

        1B13.0 Острый милиарный туберкулез одного указанного участка
        
        Определение острого милиарного туберкулеза одного указанного участка: заболевание, вызванное инфекцией бактериями Mycobacterium tuberculosis, распространяется по телу и влияет на конкретный участок тела.Это заболевание характеризуется многочисленными небольшими образованиями размером 1-5 миллиметров в любом органе и лихорадкой. Передача обычно происходит при вдыхании инфицированных респираторных выделений. Подтверждением является рентгенография, КТ, УЗИ и идентификация Mycobacterium tuberculosis, в зависимости от пораженного участка.

        1B13.1 Острый множественный милиарный туберкулез
        
        Определение множественного милиарного туберкулеза: заболевание, вызванное инфекцией бактериями Mycobacterium tuberculosis, которая распространяется по телу и поражает множество участков тела.Это заболевание характеризуется многочисленными небольшими поражениями размером 1-5 миллиметров более чем в одном органе и лихорадкой. Передача обычно происходит при вдыхании инфицированных респираторных выделений. Подтверждением является рентгенография, расширенная визуализация, ультразвуковое исследование и идентификация Mycobacterium tuberculosis, в зависимости от пораженных участков.

        1B13.Y Другой уточненный милиарный туберкулез

        1B13.Z Милиарный туберкулез неуточненный

        Код МКБ 10 по милиарному туберкулезу

        A19

        4 A19 Милиарный туберкулез
        4
        000300030003 9113 9113

        Туберкулез:

        Туберкулезный полисерозит

        A19.0 Острый милиарный туберкулез единственной уточненной локализации

        A19.1 Острый милиарный туберкулез множественной локализации

        A19.2 Острый милиарный туберкулез неуточненный

        A19.8 Другой милиарный туберкулез

        A19.9 Милиарный туберкулез неуточненный

        Код МКБ 11 для латентного туберкулеза

        1B14 Скрытый туберкулез

        Код МКБ 10

        012 9112

        для скрытого туберкулеза.7 Латентный туберкулез

        Исключения:

        • аномальный результат пробы Манту

        Z22.8 Носитель других инфекционных заболеваний

        Z22.9 Носитель инфекционного заболевания неуточненный

        Код МКБ 11 для другого уточненного туберкулеза

        1B1Y Другой уточненный туберкулез

        Код МКБ 11 для неуточненного туберкулеза

        1B1Z Туберкулез неуточненный

        Leprosy2 инфекция Mycobacterium leprae.Это заболевание обычно проявляется длительным бессимптомным периодом с последующим гранулематозным поражением кожи, дыхательных путей и периферических нервов. Передача обычно происходит капельным путем. Подтверждением является идентификация Mycobacterium leprae с помощью биопсии кожи.

        Код МКБ 11 для проказы

        1B20 Проказа

        Включения:

        • Инфекция, вызванная Mycobacterium leprae

        1B20.0 Малобациллярная лепра

        1B20.1 Мультибациллярная лепра

        1B20.2 Проказные реакции

        1B20.20 Проказная реакция I типа
        
        Определение этой лепры типа I. явление, также называемое «реакцией повышения», возникает при пограничных состояниях лепры и связано с повышением клеточного иммунитета. Обычно это происходит в течение первых 6 месяцев лечения у ранее не леченных пациентов, но может быть связано со стрессом, интеркуррентными инфекциями или беременностью.Клинические признаки включают воспалительный отек, эритему и иногда изъязвление существующих поражений, конституциональные симптомы и неврит. Если неврит не лечить немедленно, это может привести к необратимому повреждению двигательного нерва.

        1B20.21 Проказа II типа
        
        Определение реакции проказы II типа: Это явление, также называемое реакцией понижения статуса, возникает при пограничных состояниях лепры и связано со снижением клеточного иммунитета с сдвиг в сторону лепроматозного конца клинического спектра.

        1B20.3 Осложнения проказы

        1B20.Z Проказа неуточненная

        Код МКБ 10 для проказы

        A30 Проказа [болезнь Хансена]

        • Инфекция, вызванная Mycobacterium leprae

        Исключения:

        A30.0 Неопределенная лепра

        A30.1 Туберкулоидная проказа

        A30.2 Пограничная туберкулоидная лепра

        A30.3 Пограничная лепра

        A30.4 Пограничная лепроматозная проказа

        A30.5 Проказа лепроматозная

        проказа

        A30.9 Проказа неуточненная

        Инфекции, вызванные нетуберкулезными микобактериями

        Кодекс МКБ 11 для инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями

        1B21 Микобактерии, вызванные небактериями

        Определение инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями: любое состояние, вызванное инфекцией, вызываемой бактериями Mycobacterium (за исключением инфекций, вызываемых Mycobacterium tuberculosis и Mycobacterium leprae).Эти состояния обычно проявляются при заболевании легких; однако симптомы зависят от места заражения. Передача происходит при прямом контакте с Mycobacterium в окружающей среде. Подтверждением является идентификация микобактерий на пораженных участках.

        Исключения :

        1B21.0 Легочная инфекция, вызванная нетуберкулезными микобактериями
        
        Определение легочной инфекции, вызванной нетуберкулезными микобактериями: Состояние легочной системы, вызванное инфицирование бактериями Mycobacterium (за исключением инфекций, вызываемых Mycobacterium tuberculosis и Mycobacterium leprae).Это заболевание характеризуется кашлем, лихорадкой, похуданием и утомляемостью. Передача происходит при прямом контакте с Mycobacterium в окружающей среде.

        1B21.1 Нетуберкулезный микобактериальный лимфаденит

        1B21.2 Кожная нетуберкулезная микобактериальная инфекция
        
        Исключения:

        1B21.20 Инфекция микобактерий
        Определение инфекции Mycobacterium ulcerans: Инфекция Mycobacterium ulcerans (язва Бурули) обычно представляет собой подкожный узелок, который распадается с образованием глубокой безболезненной язвы, которая обычно достигает размера 15 см в диаметре, но может распространяться дальше, вызывая обширное повреждение тканей. .Этот организм встречается на заболоченных территориях тропических и субтропических регионов мира, особенно в Африке [Dermatology TAG].

        1B21.2Y Кожная инфекция, вызванная другими уточненными нетуберкулезными микобактериями

        1B21.2Z Кожная инфекция, вызванная неуточненными нетуберкулезными микобактериями

        1B21.3 Диссеминированная микобактериальная инфекция

        1B21.4 Желудочно-кишечная нетуберкулезная микобактериальная инфекция

        1B21.Y Нетуберкулезная микобактериальная инфекция другого указанного участка

        1B21.Z Нетуберкулезная микобактериальная инфекция неустановленного участка

        Кодекс МКБ 10 для инфекций, вызванных нетуберкулезными микобактериями

        A31 Инфекция, вызванная другие микобактерии

        Исключения:

        A31.0 Легочная микобактериальная инфекция

        Инфекция, вызванная микобактериями:

        • avium
        • intracellulare [Battey bacillus]
        • kansas 91 Кожная микобактериальная инфекция

          Язва Бурули Инфекция, вызванная Mycobacterium:

          A31.8 Другие микобактериальные инфекции

          A31.9 Микобактериальная инфекция неуточненная

          • Atypical Mycobacterium инфекция

          Код МКБ 11 для других уточненных микобактериальных болезней

          1B2Y Другие уточненные микобактериальные болезни

          Код МКБ 11 для неуточненных микобактериальных заболеваний

          1B2Z Микобактериальные болезни неуточненные d ​​Novel

          Действия против Mycobacterium tuberculosis

          ВВЕДЕНИЕ

          Mycobacterium tuberculosis — основная причина смерти от одного инфекционного агента во всем мире (1).Лечение, рекомендованное в настоящее время для лечения лекарственно-чувствительных микобактерий туберкулеза, представляет собой двухмесячный курс интенсивной химиотерапии четырьмя антибиотиками первой линии рифампицин, изониазид, пиразинамид и этамбутол с последующей фазой продолжения от 4 до 6 месяцев, состоящей из рифампицина. и изониазид (1). Плохое соблюдение пациентом режима лечения из-за длительного лечения и токсических побочных эффектов этих соединений привело к появлению штаммов M. tuberculosis с множественной и широкой лекарственной устойчивостью (2, 3), что подчеркивает необходимость новых вариантов лечения.Большинство антибиотиков, начиная с пенициллина и стрептомицина, являются натуральными продуктами или их производными (4, 5). Однако неспособность культивировать большинство бактерий в лабораторных условиях, а также постоянное повторное открытие известных соединений привели к снижению отдачи, и к 1960-м годам от усилий по скринингу натуральных продуктов в значительной степени отказались (6). Усовершенствованные методы выращивания ранее некультивируемых бактерий теперь обеспечивают доступ к незадействованному биологическому и химическому разнообразию. Ранее некультивируемая бактерия Eleftheria terrae производит тейксобактин, новый ингибитор действия на клеточную стенку (7).Мы также внедрили подход селективного скрининга, направленный на устранение большого количества токсичных и известных соединений. Скрининг экстрактов некультивируемых бактерий против M. tuberculosis и противодействие Staphylococcus aureus привели к открытию лассомицина, продуцируемого Lentzea sp., Который нацелен на субъединицу C1 основной протеазы P1P2C1 микобактерий (8).

          Здесь мы сообщаем об идентификации трех новых противомикробных препаратов из ранее некультивируемых бактерий с селективной активностью против M.туберкулез. Стрептомикобактин представляет собой катионный депсипептид, китамикобактин представляет собой пептид лассо, для активности которого требуется нативный С1, а амикобактин представляет собой новый противомикробный препарат, нацеленный на белок SecY системы секреции микобактерий.

          ОБСУЖДЕНИЕ

          Недавняя работа подтвердила силу открытия натуральных продуктов для создания новых многообещающих противомикробных препаратов (27–29). Здесь мы обратили внимание на ранее не культивируемые микробы как на новый источник антимикобактерий. Сочетание этого метода с дифференциальным скринингом соединений, избирательно действующих против M.tuberculosis, мы определили три новых противомикробных препарата с активностью против микобактерий и определили мишени для двух из них, амикобактина и китамикобактина.Амикобактин непосредственно нацелен на секрецию белка с помощью механизма транслокации Sec и, насколько нам известно, представляет собой первый натуральный продукт, нацеленный на механизм секреции белка. . Амикобактин обладает бактериостатическим действием против экспоненциально растущих M. tuberculosis, но бактерицидным против M. tuberculosis в стационарной фазе, что вызывает недоумение, поскольку антибиотики обычно более эффективны против активно растущих клеток.Хотя амикобактин, вероятно, блокирует секрецию жизненно важных белков в обоих состояниях, его бактерицидная активность в стационарной фазе может быть связана с феноменом «заклинивания» транслокона Sec (30). Когда секреция через механизм транслокации Sec не работает, транслоказа SecY «забивается» линейным пептидом. Ответ клетки направлен на разрушение всего аппарата клеточными протеазами. Сам по себе этот процесс может быть фатальным для клетки (30). Экспоненциально растущие клетки могут легко заменить разрушенный механизм Sec.Однако пониженное метаболическое состояние клеток стационарной фазы может ограничивать производство новых компонентов секреции Sec, что приводит к гибели амикобактином. Существенными компонентами механизма транслокации Sec у M. tuberculosis и M. smegmatis являются SecY, SecE и SecA. (17). SecE образует «зажим» возле боковых ворот SecY для стабилизации конструкции (22). SecA обеспечивает распознавание секретируемых белков, а также энергию для секреции путем гидролиза АТФ (31). Амикобактин может нарушать взаимодействие SecY с SecE или SecA, подавляя секрецию.В качестве альтернативы амикобактин может действовать непосредственно на SecY. Секреция через SecY ограничена гидрофобным центральным кольцом и заглушкой канала; последний смещается во время секреции (22). Амикобактин может ограничивать смещение пробки канала в WT SecY, что приводит к блокированию секреции. Удаление аминокислот с 407 по 409 может облегчить эту блокировку, обеспечивая большую гибкость в заглушке канала. Высокий МИК и узкое терапевтическое окно амикобактина предполагают, что это ранний вывод, который может быть дополнительно оптимизирован.Его ингибирование секреции белка также делает его привлекательным инструментом для изучения механизма транслокации Sec. Важность механизма секреции Sec затрудняет изучение его вклада в вирулентность. Учитывая, что некоторые белки, связанные с вирулентностью, секретируются с помощью механизма Sec (17, 32), инструмент для изучения этого аспекта физиологии M. tuberculosis был бы неоценимым. Принимая во внимание эти соображения вместе, эта работа подчеркивает силу открытия натуральных продуктов для создания многообещающих новых антибиотиков с новыми механизмами действия против M.туберкулез.

          МАТЕРИАЛЫ И МЕТОДЫ

          Штаммы бактерий и условия роста.

          В качестве штаммов M. tuberculosis использовались h47Rv и h47Rv mc ² 6020, где указано. Штамм M. smegmatis mc ² 155 использовался для всех исследований M. smegmatis. Штамм M. avium ATCC 700898, штамм M. abscessus ATCC 19977 и штамм M. paratuberculosis ATCC 43544 использовали для определения чувствительности к антибиотикам. Все штаммы микобактерий выращивали в среде Difco 7H9 с добавлением 10% олеиновой кислоты, альбумина, декстрозы и каталазы (OADC) и 5% глицерина.Лизин (80 мкг / мл) и пантотенат (24 мкг / мл) добавляли к среде mc ² 6020. Тилоксапол добавляли к жидким культурам до конечной концентрации 0,05%. Микобактин J (Allied Monitor) добавляли к культурам M. paratuberculosis в конечной концентрации 10 мг / л. Bacteroides fragilis ATCC 25282D-5 и Lactobacillus reuteri ATCC 23272 выращивали в бульоне для инфузии сердца мозга с добавлением (на литр) 5 г дрожжевого экстракта, 10 мл 10% (вес / объем) l-цистеина HCl, 15 мг / литр гемина и 66 мл 1.5 M 3- ( N -морфолино) пропансульфоновая кислота [MOPS; pH 7,0] в анаэробной камере. При необходимости, канамицин использовали в конечной концентрации 50 мг / л.

          Выделение и культивирование почвенных бактерий.

          Образцы почвы (1 г) интенсивно перемешивали в 10 мл деионизированной воды в течение 10 минут, а затем оставляли на 10 минут для осаждения крупных частиц почвы. Супернатант разбавляли расплавленной средой SMS ((0,125 г казеина, 0,1 г картофельного крахмала, 1 г казаминокислоты, 20 г агара Бакто в 1 литре воды).Затем аликвоты распределяли в лунки 96-луночных микротитровальных планшетов или iChips (10). Планшеты для микротитрования инкубировали при комнатной температуре в увлажненных камерах в течение 12 недель, и еженедельно контролировали появление колоний. С недельными интервалами, начиная с 4 недель, колонии собирали на среду SMS. IChips были помещены в прямой контакт с почвой. После 4 недель инкубации iChip разбирали и собирали колонии на среду SMS, чтобы проверить способность размножаться за пределами iChip и очистить колонии.Исходные образцы глицерина (15% глицерина) были приготовлены для изолятов с устойчивым ростом на среде SMS.

          Приготовление экстракта и скрининг.

          Изоляты из коллекции NovoBiotic были перенесены в семенной бульон (15 г глюкозы, 10 г солодового экстракта, 10 г глицерина, 2,5 г дрожжевого экстракта, 5 г казаминовых кислот и 0,2 г стружки карбоната кальция · 2H ₂ O на литр деионизированной H ₂ O [pH 7,0]) и инкубировали при энергичном перемешивании при 28 ° C в течение 5-12 дней, пока культура не стала мутной (при визуальном осмотре).Время помутнения зависит от изолята. Затем посевную культуру разводили 1:20 в трех разных ферментационных средах. После 11 дней роста при 28 ° C с перемешиванием культуры были высушены. Диметилсульфоксид (ДМСО) добавляли к высушенной биомассе и перемешивали, и неочищенные экстракты проверяли на активность против S. aureus. Аликвоту по 5 мкл каждого экстракта наносили на лужайку S. aureus, растущую на агаре Мюллера-Хинтона. После инкубации в течение ночи при 37 ° C наличие очищающей зоны указывало на активность попадания.

          Экстракты тестировали против M. tuberculosis путем переноса 1,5 мкл экстрактов в лунки 96-луночного микротитровального планшета. Культуру M. tuberculosis mc ² 6020, экспрессирующую mCherry, выращивали в бульоне Миддлбрука 7H9 при 37 ° C с перемешиванием до оптической плотности 0,4-0,5 при 600 нм (OD ₆₀₀ ). Культуру разбавляли до OD ₆₀₀ 0,003 и в лунки добавляли 148,5 мкл культуры (разведение 1: 100). После 7 дней инкубации при перемешивании при 37 ° C рост контролировали путем измерения OD ₆₀₀ и измерения флуоресценции с возбуждением при 580 нм и испусканием при 610 нм.Экстракты, которые продемонстрировали рост ≤25% по сравнению с ростом контрольных образцов с положительным приростом ДМСО, были собраны и повторно протестированы в тех же условиях анализа. Эти экстракты также тестировали при разведении 1: 100 в анализе микроразбавления бульона против S. aureus. Экстракты, не влияющие на рост S. aureus, которые повторяли ингибирование роста M. tuberculosis, считались подтвержденными попаданиями.

          Три штамма были выбраны для дополнительной ферментации, чтобы обеспечить материал. IS019924, IS019923 и IS008612 — штаммы-продуценты амикобактина, стрептомикобактина и китамикобактина соответственно.Выращенную биомассу каждого изолята инокулировали в 50 мл посевного бульона и выращивали при встряхивании при 200 об / мин в течение 3-8 дней. Культуры ежедневно контролировали визуально на предмет устойчивого роста. 2% посевной материал посевной культуры переносили в 500 мл ферментационной среды в 2-литровых колбах с 6 перегородками при 28 ° C, встряхивали при 200 об / мин и собирали через 7 дней. IS019924 ферментировали в ферментационной среде BPM [20 г глюкозы, 10 г органической соевой муки (органическая цельномолотая соевая мука Bob’s Red Mill), 10 г Pharmamedia (протеин Traders), 1 г (NH ₄ ) ₂ SO ₄ , 10 г CaCO ₃ и 20 г глицерина в 1 литре] и потребовалось всего 40 литров продукции для выделения материала, достаточного для характеристики амикобактина.IS019923 и IS008612 ферментировали в ферментационной среде R4 (описанной ранее Ling et al. [7]), и им требовалось 40 литров для выделения достаточного количества материала.

          Протокол выделения амикобактина.

          Бродильный бульон IS019924 (10 литров) центрифугировали при 17,700 × г в течение 30 мин. Супернатант декантировали и медленно пропускали через колонку со смолой HP20. Смолу HP20 элюировали с использованием ступенчатого градиента (2 литра 30% ацетона в воде, 2 литра 80% ацетона в воде и 2 литра 100% ацетона).Осадок клеток экстрагировали ацетоном и фильтровали. Экстракт гранул ацетона сушили на смоле HP20 с помощью роторного испарителя. Смолу HP20, содержащую экстракт гранул, промывали деионизированной водой (1 литр) и элюировали с использованием ступенчатого градиента (1 литр 20% ацетона в воде, 1 литр 40% ацетона в воде, 1 литр 60% ацетона в воде, 1 литр 80% ацетона в воде и 1 литр 100% ацетона). Было определено, что амикобактин присутствует в 80% фракции супернатанта и в 60% и 80% фракциях экстракта осадка.Эти фракции были объединены, полностью высушены и затем восстановлены в метаноле. Эту смесь дополнительно разделяли на колонке со смолой Lh30 (элюировали метанолом), получая 3 фракции, содержащие амикобактин. Эти фракции снова были объединены и полностью высушены. Остаток растворяли в ДМСО и разделяли с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9,4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1 % трифторуксусной кислоты [TFA], растворитель B, ацетонитрил [ACN] –0.1% TFA; градиент, 10% B от 0 до 3 минут и от 10% до 100% B от 3 до 20 минут; скорость потока 3,0 мл / мин). Амикобактин элюировался через 19 мин, и была проведена вторая очистка с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9,4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1% TFA, растворитель B, ACN – 0,1% TFA, градиент, 55% B от 0 до 3 минут и от 55% до 100% B от 3 до 20 минут, скорость потока 3,0 мл / мин). Очищенный амикобактин элюируется из колонки через 10 мин. Фракции, содержащие амикобактин, лиофилизировали для подготовки к структурному анализу и биологическому тестированию.

          Протокол выделения стрептомикобактина.

          Ферментационный бульон (8,5 л) центрифугировали при 17,700 × g в течение 45 мин. Осадок клеток экстрагировали 1 литром ацетона. Супернатант экстрагировали 2 литрами n -бутанола, а водный слой отбрасывали. Экстракт осадка ацетона и экстракт супернатанта n -бутанол добавляли в отдельные круглодонные колбы, и в каждую колбу добавляли HP20. Органические растворители удаляли на роторном испарителе.Смолы HP20 промывали деионизированной водой и элюировали с использованием ступенчатого градиента (25% ацетон в воде, 50% ацетон в воде и 100% ацетон). Стрептомикобактин был обнаружен в 50% и 100% элюциях. Затем эти элюции объединяли и сушили, оставляя коричневый остаток. К остатку добавляли гексан, который затем обрабатывали ультразвуком и центрифугировали. Затем гексановый экстракт отбрасывали, остаток растворяли в ДМСО и разделяли с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9.4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1% TFA; растворитель B, ACN – 0,1% TFA; градиент от 80% A до 55% B за 22 мин; скорость потока 3,0 мл / мин). Фракции, содержащие стрептомикобактин, объединяли и лиофилизировали, чтобы получить белый порошок.

          Протокол изоляции, используемый для

          ¹³ C- и ¹⁵ N-меченного стрептомикобактина.

          Выращенную биомассу IS019923 инокулировали в 20 мл модифицированного CM-R4 (10 г MgCl ₂ · 6H ₂ O, 4 г CaCl ₂ · 2H ₂ O, 0.2 г K ₂ SO ₄ , 5,6 г 2 — [{1,3-дигидрокси-2- (гидроксиметил) пропан-2-ил} амино] этансульфоновая кислота [свободная кислота TES], 10 г ¹³ C-меченая глюкоза [U- ¹³ C ₆ , 99%; CLM-1396-5; Cambridge Isotope Laboratories], 10 мл 0,25 г / мл ¹³ C-, ¹⁵ N-меченный базовый порошок Celtone [ ¹³ C, 98% +; ¹⁵ N 98% +; CGM-1030P-CN-1; Cambridge Isotope Laboratories]) с pH, доведенным до 7,0. Культуру помещали на роторный шейкер при 200 об / мин и 28 ° C на 7 дней.Культуру ежедневно визуально контролировали на предмет устойчивого роста, который плотно прилегал к стенкам колбы на границе раздела жидкость-воздух. 2% инокулят этой культуры переносили в 500 мл модифицированной среды CM-R4 в 2-литровую колбу с 6 перегородками при 28 ° C, встряхивали при 200 об / мин и собирали через 9 дней.

          Ферментационный бульон (500 мл) центрифугировали при 17,700 × g в течение 45 мин. Супернатант декантировали в пустые центрифужные флаконы, смешивали с равным объемом n -бутанола и затем центрифугировали.Осадок клеток экстрагировали 200 мл ацетона, обрабатывали ультразвуком в течение 10 мин, а затем центрифугировали. Экстракт гранул ацетона и экстракт супернатанта n -бутанол смешивали вместе в круглодонной колбе и добавляли HP20. Органические растворители удаляли на роторном испарителе. Смолу HP20 промывали деионизированной водой и элюировали с использованием ступенчатого градиента (500 мл 20% ацетона в воде, 500 мл 50% ацетона в воде и 500 мл 100% ацетона). Меченый стрептомикобактин был обнаружен в 50% и 100% элюциях, которые сушили отдельно, оставляя коричневые остатки.Эти остатки растворяли в ДМСО, разделяли с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9,4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1% TFA; растворитель B, ACN – 0,1% TFA; градиент от 90% A до 100% B в течение 22 минут; скорость потока 3,0 мл / мин). Фракции, содержащие меченый стрептомикобактин, объединяли и лиофилизировали, получая белый порошок. Порошок растворяли в ДМСО, а затем образец повторно очищали с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9.4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1% TFA; растворитель B, ACN – 0,1% TFA; градиент от 80% A до 55% B за 22 мин; скорость потока 3,0 мл / мин). Фракции, содержащие ¹³ C- и ¹⁵ N-меченный стрептомикобактин, объединяли и лиофилизировали, получая 10,4 мг белого порошка.

          Протокол выделения китамикобактина.

          Ферментационный бульон центрифугировали при 17,700 × g в течение 45 мин. Супернатант сливали в делительную воронку, а оставшийся клеточный осадок экстрагировали ацетоном перед центрифугированием.Ацетоновый экстракт переносили в круглодонную колбу и ацетон удаляли роторным испарителем. Оставшийся водный слой добавляли к супернатанту, а затем смесь экстрагировали n -бутанолом. Водный слой удаляли, а бутанол n переносили в круглодонную колбу. n -бутанол удаляли с помощью роторного испарителя. Оставшийся остаток растворяли в ДМСО и затем очищали с помощью ВЭЖХ (колонка Agilent Zorbax SB-C ₁₈ ; размер частиц 5 мкм; внутренний диаметр 9.4 мм; длина 250 мм) (растворитель A, H ₂ O – 0,1% TFA; растворитель B, ACN – 0,1% TFA; градиент от 90% A до 100% B в течение 22 мин; скорость потока 3,0 мл / мин). Китамикобактин элюируется через 24 мин. Затем фракцию лиофилизировали, чтобы получить белый порошок.

          ЯМР.

          Спектрометр Bruker DRX 500-МГц, оборудованный зондами BBI и QNP, использовался для записи спектров амикобактина и китамикобактина. Образцы растворяли в диметилсульфоксиде- d ₆ (Cambridge Isotope Laboratories, Андовер, Массачусетс) и нагревали до 40 ° C для сбора данных.Структурные отнесения амикобактина (текст S1) и китамикобактина (текст S1) были сделаны на основании данных одномерного (1D) и 2D ядерного магнитного резонанса (ЯМР) из ¹ H, ¹³ C, COSY, TOCSY, ¹ H- ¹³ C / ¹⁵ N HSQC, ¹ H- ¹³ C HMBC и эксперименты NOESY / ROESY (текст S1). Спектрометр Bruker Avance III HD, работающий на частоте ¹ H, равной 700,13 МГц, оснащенный криогенно охлаждаемым тройным резонансным 5-мм зондом HCN, использовался для регистрации спектров образца [ ¹³ C, ¹⁵ N ] стрептомикобактин растворяли в диметилсульфоксиде- d ₆ (Cambridge Isotope Laboratories, Андовер, Массачусетс) в пробирке для образца, и образец нагревали до 35 ° C для сбора данных.Структура стрептомикобактина была определена на основе серии экспериментов 1D, 2D и 3D ЯМР с использованием образца [ ¹³ C, ¹⁵ N] стрептомикобактина (текст S1). Для назначений пептидилового остова ¹³ C эксперименты HNCACB и HNCOCACB были оптимизированы для быстрого сбора данных с использованием параметров, опубликованных P. Schanda et al. в 2006 г. (33). Назначения боковых цепей были картированы с помощью экспериментов (H) CCCONH и H (CCCO) NH для назначений ¹³ C и ¹ H соответственно (текст S1).

          MIC.

          МИК определяли с помощью микроразбавления бульона. Концентрации клеток доводили до OD ₆₀₀ 0,003 в среде 7H9 с добавлением 10% OADC, 5% глицерина и 0,05% тилоксапола. Пантотенат (24 мкг / мл) и лизин (80 мкг / мл) добавляли к культурам h47Rv mc ² 6020. Планшеты инкубировали при 37 ° C в течение 7 дней (M. tuberculosis, M. paratuberculosis, M. avium), 3 дней (M. smegmatis, M. abscessus) или 20 часов (B. fragilis, L. reuteri). B. fragilis и L.reuteri выращивали в анаэробных условиях. МИК определяли как самую низкую концентрацию антибиотика без видимого роста.

          Цитотоксичность млекопитающих.

          Экспоненциально растущие эмбриональные фибробласты мыши NIH / 3T3 (ATCC CRL-1658) в среде Игла, модифицированной Дульбекко, с добавлением 10% бычьей телячьей сыворотки и клеток HepG2 (ATCC HB-8065) ​​в модифицированной Дульбекко среде Игла с добавлением 10% эмбриональной сыворотки теленка. засевают в 96-луночные планшеты с плоским дном. После 24 ч инкубации при 37 ° C среду заменяли свежей средой, содержащей 2-кратные серийные разведения тестируемых соединений.После 72 часов инкубации при 37 ° C жизнеспособность определяли с помощью набора для анализа пролиферации клеток CellTiter 96 AQueous One Solution (номер по каталогу G3580; Promega) в соответствии с рекомендациями производителя.

          Убийство, зависящее от времени.

          Экспоненциально-фазовые культуры получали выращиванием M. tuberculosis до среднеэкспоненциальной фазы (OD ₆₀₀ , от ~ 1 до 1,5) с последующим обратным разведением до OD ₆₀₀ 0,003. Для культур в стационарной фазе M. tuberculosis выращивали в течение 2 недель до OD ₆₀₀ > 1.5. Культуры заражали либо 4 × MIC (амикобактин), либо 10 × MIC (стрептомикобактин, китамикобактин и марфомицин D) соединения при 37 ° C. Через определенные промежутки времени отбирали аликвоты по 100 мкл, один раз промывали фосфатно-солевым буфером (PBS), серийно разбавляли и высевали на среду 7h20 для определения количества КОЕ на миллилитр.

          Поколение мутанта амикобактина.

          Мутанты, устойчивые к амикобактину в M. smegmatis, отбирали путем посева на среду 7h20, содержащую амикобактин при 10-кратном МИК дикого типа.Вкратце, 10 мл M. smegmatis дикого типа выращивали до OD ₆₀₀ ~ 1,0. Культуру промывали один раз и концентрировали до 1/10 первоначального объема (1 мл). Затем культуру высевали на пять планшетов 7h20, содержащих амикобактин 10 × MIC. Мутанты наносили штрихами на неселективную среду и определяли MIC. Мутанты были отправлены на полногеномное секвенирование, а анализ вариантов был проведен с помощью MR ДНК. Целевые мутации были сделаны в M. smegmatis и M. tuberculosis посредством одноцепочечной рекомбинации, как в ссылке 19, с посевом на амикобактин 10 × MIC.Олигонуклеотиды, используемые для получения целевых мутаций были 5′-CGAGACCGACACCGATCATGATCAGAACCGCGGTCGGCAGGTTCTGTACCGAACCGGTGTTCCCGATCTC-3 ‘для Msm ΔsecY 3AA, 5′-CCCTGCTCGACGAACACCACGCCGATGATGATCACGGCGGTGAACACGACGCCGCCGCGGCTCTCCAGGA-3′ для Msm ΔsecY 6AA и 5′-CCAAACCGACACCGATCATGATCAGCACCGCGGTAGGCAGGTTCTGCACGGTTCCACCGGCGCCGATCTG-3 ‘для Mtb ΔsecY 3AA . Целевые мутации были подтверждены с помощью ПЦР и секвенирования по Сэнгеру.

          Анализ активности β-лактамазы и вестерн-блоттинг.

          Дубликаты 10-миллилитровых культур репортерного штамма M. smegmatis ‘BlaTEM-1 выращивали в минимальной среде с 0,02% глюкозы и 0,05% Твина 80 до поздней экспоненциальной фазы. Культуры дважды промывали в минимальной среде (34) и ресуспендировали в 1 мл минимальной среды с 0,02% глюкозы и без Твина 80. Одну культуру оставляли необработанной, а другую обрабатывали амикобактином 10 × МИК. Культуры инкубировали в статическом инкубаторе 37 ° C в течение 3 ч при осторожном перемешивании каждые 30 мин. Затем бактерии осаждали, супернатант осторожно аспирировали и фильтровали через фильтр 0.Фильтр 45 мкм (Costar). Затем фильтрат концентрировали в 10 раз, используя центробежную колонку с отсечкой по молекулярной массе 3 кДа (Millipore). Осажденные бактерии ресуспендировали в PBS и подвергали взбиванию шариками для лизирования клеток. Образцы вращали со скоростью 12000 об / мин в течение 5 минут, и очищенный лизат аспирировали. Набор бицинхониновой кислоты (BCA) Thermo Fisher использовали для количественного определения выхода белка. Активность β-лактамазы контролировали по гидролизу нитроцефина. Всего 10 мкг белка разбавляли до конечного объема 100 мкл в PBS и добавляли в 96-луночный планшет.Добавляли 100 мкл смеси для анализа, содержащей 100 мкг / мл нитроцефина, 200 мкг / мл бычьего сывороточного альбумина (BSA) и 10% глицерина. Активность β-лактамазы контролировали, считывая оптическую плотность при 490 нм и 390 нм каждые 5 минут в течение 1 часа. Вестерн-блоттинг проводили путем прогона 5 мкг общего белка из каждого образца на 4-20% трис-глициновом геле Novex (Invitrogen) с последующим переносом на мембрану из поливинилидендифторида (PVDF). Антитело против β-лактамазы E. coli было приобретено в QED Biosciences и использовалось в разведении 1: 5000 в 5% молоке; смесь инкубировали в течение ночи.Денситометрию выполняли с помощью программного обеспечения ImageJ.

          Описание структуры белка.

          Система молекулярной графики PyMOL, версия 2.3.3 (Schrödinger), использовалась для изображения белков.

          Статистический анализ.

          Анализ проводился с помощью GraphPad Prism, версия 7.

          БЛАГОДАРНОСТИ

          Эта работа была поддержана грантом Фонда Гейтса OPP1132809 для D.H. и K.L., грантом NIH AI118058 для L.L.L. и грантом NIH P01AI118687 для K.L.

          М.Репортерный штамм β-лактамазы smegmatis был любезно предоставлен Мириам Браунштейн из Медицинской школы Университета Северной Каролины.

          J.Q., M.G., C.A., A.D., C.F., S.M., W.M., A.N., B.T., A.S., A.Z. и C.A. проводил эксперименты. J.Q., D.H., L.L.L., A.P. и A.S. проанализированные данные. К.Л. разработал эксперименты. J.Q., A.P., D.H., L.L.L. и K.L. написал газету.

          Расшифровка биологии Mycobacterium tuberculosis на основе полной последовательности генома

        • 1

          Snider, D.E. J, Raviglione, M. и Kochi, A. в Туберкулез: патогенез, защита и контроль (изд. Bloom, BR) 2–11 (Am. Soc. Microbiol., Вашингтон, округ Колумбия, (1994).

          Google ученый

        • 2

          Wheeler, PR & Ratledge, C. in Tuberculosis: Pathogenesis, Protection, and Control (ed. Bloom, BR) 353–385 (Am. Soc. Microbiol., Вашингтон, округ Колумбия, (1994).

          )

          Книга Google ученый

        • 3

          Чан, Дж.& Kaufmann, S.H.E. в книге Tuberculosis: Pathogenesis, Protection, and Control (ed. Bloom, B.R.) 271–284 (Am. Soc. Microbiol., Вашингтон, округ Колумбия, (1994).

          ) Google ученый

        • 4

          Brennan, PJ & Draper, P. в Туберкулез: патогенез, защита и контроль (изд. Bloom, BR) 271–284 (Am. Soc. Microbiol., Вашингтон, округ Колумбия, (1994).

          Книга Google ученый

        • 5

          Колаттукуды, П.Э., Фернандес, Н. Д., Азад, А. К., Фицморис, А. М., Сиракова, Т. Д. Биохимия и молекулярная генетика биосинтеза липидов клеточной стенки у микобактерий. Мол. Microbiol. 24 , 263–270 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 6

          Среевацан, С. и др. . Ограниченный структурный полиморфизм гена в комплексе Mycobacterium tuberculosis указывает на эволюционно недавнее глобальное распространение. Proc. Natl Acad. Sci. США 94 , 9869–9874 (1997).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 7

          Brosch, R. et al. . Использование библиотеки бактериальных искусственных хромосом Mycobacterium tuberculosis h47Rv для картирования генома, секвенирования и сравнительной геномики. Заражение. Иммун. 66 , 2221–2229 (1998).

          CAS PubMed PubMed Central Google ученый

        • 8

          Филипп, W.J. и др. . Интегрированная карта генома туберкулезной палочки, Mycobacterium tuberculosis h47Rv, и сравнение с Mycobacterium leprae . Proc. Natl Acad. Sci. USA 93 , 3132–3137 (1996).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 9

          Блаттнер, Ф. Р. и др. . Полная последовательность генома Escherichia coli K-12. Наука 277 , 1453–1462 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 10

          Коул, С. Т. и Сен-Жиронс, И. Бактериальная геномика. FEMS Microbiol. Ред. 14 , 139–160 (1994).

          CAS Статья Google ученый

        • 11

          Freiberg, C. и др. . Молекулярная основа симбиоза между Rhizobium и бобовыми. Nature 387 , 394–401 (1997).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 12

          Бардаров С. и др. . Условно реплицирующиеся микобактериофаги: система доставки транспозона в Mycobacterium tuberculosis . Proc. Natl Acad. Sci. USA 94 , 10961–10966 (1997).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 13

          Махайрас, Г.Г., Сабо, П. Дж., Хики, М. Дж., Сингх, Д. С. и Стовер, К. К. Молекулярный анализ генетических различий между Mycobacterium bovis BCG и вирулентным M. bovis . J. Bacteriol. 178 , 1274–1282 (1996).

          CAS Статья Google ученый

        • 14

          Кунст, Ф. и др. . Полная последовательность генома грамположительной бактерии Bacillus subtilis . Природа 390 , 249–256 (1997).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 15

          Смит Д. Р. и др. . Мультиплексное секвенирование 1,5 МБ генома Mycobacterium leprae . Genome Res. 7 , 802–819 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 16

          Greenacre, M. Теория и применение анализа соответствий (Academic, London, 1984).

          MATH Google ученый

        • 17

          Ratledge, C. R. в Биология микобактерий (редакторы Ratledge, C. & Stanford, J.) 53–94 (Academic, San Diego, (1982).

          ) Google ученый

        • 18

          Ав-Гей, Ю. и Дэвис, Дж. Компоненты сигнальных путей эукариотических белков в Mycobacterium tuberculosis . Microb. Комп. Genomics 2 , 63–73 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 19

          Коул, С. Т. и Теленти, А. Устойчивость к лекарствам Mycobacterium tuberculosis . Eur. Респ. Ред. 8 , 701 S – 713S (1995).

          Google ученый

        • 20

          Riley, M. и Labedan, B. in Escherichia coli and Salmonella (изд. Neidhardt, F. C.) 2118–2202 (ASM, Вашингтон, (1996).

          Google ученый

        • 21

          Mdluli, K. et al. . Ингибирование β-кетоацил АПФ синтазы Mycobacterium tuberculosis изониазидом. Наука 280 , 1607–1610 (1998).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 22

          Banerjee, A. и др. . inhA , ген, кодирующий мишень для изониазида и этионамида в Mycobacterium tuberculosis . Science 263 , 227–230 (1994).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 23

          Хопвуд, Д. А. Генетический вклад в понимание поликетидсинтаз. Chem. Ред. 97 , 2465–2497 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 24

          Минникин Д. Э. в Биология микобактерий (ред. Ратледж, К.И Stanford, J.) 95–184 (Academic, London, 1982).

          Google ученый

        • 25

          Барри, К. Э. II и др. . Миколиновые кислоты: структура, биосинтез и физиологические функции. Прог. Lipid Res. (в печати).

        • 26

          Белисл, Дж. Т. и др. . Роль основного антигена Mycobacterium tuberculosis в биогенезе клеточной стенки. Science 276 , 1420–1422 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 27

          Marahiel, M. A., Stachelhaus, T. & Mootz, H. D. Модульные пептидные синтетазы, участвующие в синтезе нерибосомных пептидов. Chem. Ред. 97 , 2651–2673 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 28

          Гобин Дж. и др. . Приобретение железа с помощью Mycobacterium tuberculosis : выделение и характеристика семейства железосвязывающих экзохелинов. Proc. Natl Acad. Sci. США 92 , 5189–5193 (1995).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 29

          Young, DB & Fruth, U. в New Generation Vaccines (eds Levine, M., Woodrow, G., Kaper, J. & Cobon, GS) 631–645 (Marcel Dekker, New York, (1997).

          Google ученый

        • 30

          Соренсен, А. Л., Нагаи, С., Хоуэн, Г., Андерсен, П. и Андерсон, А. Б. Очистка и характеристика низкомолекулярного Т-клеточного антигена, секретируемого Mycobacterium tuberculosis . Заражение. Иммун. 63 , 1710–1717 (1995).

          CAS PubMed PubMed Central Google ученый

        • 31

          Hermans, P. W. M., van Soolingen, D. & van Embden, J. D. A. Характеристика основного полиморфного тандемного повтора в Mycobacterium tuberculosis и его потенциальное использование в эпидемиологии Mycobacterium kansasiiord и gona Mycobacterium. J. Bacteriol. 174 , 4157–4165 (1992).

          CAS Статья Google ученый

        • 32

          Poulet, S. & Cole, S.T. Характеристика полиморфной GC-богатой повторяющейся последовательности (PGRS), присутствующей в Mycobacterium tuberculosis . Arch. Microbiol. 163 , 87–95 (1995).

          CAS Статья Google ученый

        • 33

          Коул, С.T. & Barrell, B.G. в Genetics and Tuberculosis (eds Chadwick, D. J. & Cardew, G., Novartis Foundation Symp. 217 ) 160–172 (Wiley, Chichester, (1998).

          Book Google ученый

        • 34

          Вега-Лопес, Ф. и др. . Последовательность и иммунологическая характеристика богатого серином антигена из Mycobacterium leprae . Заражение. Иммун. 61 , 2145–2153 (1993).

          CAS PubMed PubMed Central Google ученый

        • 35

          Abou-Zeid, C. и др. . Генетический и иммунологический анализ Mycobacterium tuberculosis фибронектин-связывающих белков. Заражение. Иммун. 59 , 2712–2718 (1991).

          CAS PubMed PubMed Central Google ученый

        • 36

          Робертсон, Б. Д.И Мейер, Т. Ф. Генетическая изменчивость патогенных бактерий. Trends Genet. 8 , 422–427 (1992).

          CAS Статья Google ученый

        • 37

          Левицкая Дж. и др. . Ингибирование процессинга антигена областью внутреннего повтора ядерного антигена-1 вируса Эпштейна-Барра. Nature 375 , 685–688 (1995).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 38

          Левицкая, Ю., Sharipo, A., Leonchiks, A., Ciechanover, A. & Masucci, M.G. Ингибирование убиквитин / протеасомозависимой деградации белка доменом повторов Gly-Ala ядерного антигена вируса Эпштейна-Барра 1. Proc. Natl Acad. Sci. USA 94 , 12616–12621 (1997).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 39

          Флинн, Дж. Л., Гольдштейн, М. А., Трейболд, К. Дж., Коллер, Б. и Блум, Б. Р. Для устойчивости к инфекции Mycobacterium tuberculosis требуются Т-клетки, ограниченные классом I главного комплекса гистосовместимости. Proc. Natl Acad. Sci. США 89 , 12013–12017 (1992).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 40

          Bloom, BR & Fine, PEM in Tuberculosis: Pathogenesis, Protection, and Control (ed. Bloom, BR) 531–557 (Am. Soc. Microbiol., Вашингтон, округ Колумбия, (1994).

          ) Книга Google ученый

        • 41

          Коллинз, Д. М.В поисках генов вирулентности туберкулеза. Trends Microbiol. 4 , 426–430 (1996).

          CAS Статья Google ученый

        • 42

          Arruda, S., Bomfim, G., Knights, R., Huima-Byron, T. & Riley, L. W. Клонирование фрагмента ДНК M. tuberculosis , связанного с проникновением и выживанием внутри клеток. Science 261 , 1454–1457 (1993).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 43

          Баумлер, А.J., Kusters, J.G., Stojikovic, I. & Heffron, F. Локусы Salmonella typhimurium , участвующие в выживании внутри макрофагов. Заражение. Иммун. 62 , 1623–1630 (1994).

          CAS PubMed PubMed Central Google ученый

        • 44

          МакМюррей А.А., Салстон Дж. Э. и Квейл М.А. Библиотеки с короткими вставками как метод решения проблем при секвенировании генома. Genome Res. 8 , 562–566 (1998).

          CAS Статья Google ученый

        • 45

          Бонфилд, Дж. К., Смит, К. Ф. и Стаден, Р. Программа сборки новой последовательности ДНК. Nucleic Acids Res. 24 , 4992–4999 (1995).

          Артикул Google ученый

        • 46

          Крог, А., Миан, И. С. и Хаусслер, Д. Ахидден Марковская модель, которая обнаруживает гены в ДНК E. coli . Nucleic Acids Res. 22 , 4768–4778 (1994).

          CAS Статья Google ученый

        • 47

          Bairoch, A., Bucher, P. & Hofmann, K. База данных PROSITE, ее состояние в 1997 году. Nucleic Acids Res. 25 , 217–221 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        • 48

          Альтшул, С., Гиш, В., Миллер, В., Майерс, Э. и Липман, Д. Инструмент поиска локального выравнивания Abasic. J. Mol. Биол. 215 , 403–410 (1990).

          CAS Статья Google ученый

        • 49

          Пирсон, В. и Липман, Д. Усовершенствованные инструменты для сравнения биологических последовательностей. Proc. Natl Acad. США 85 , 2444–2448 (1988).

          ADS CAS Статья Google ученый

        • 50

          Лоу, Т. М. и Эдди, С. Р. tRNAscan-SE: программа для улучшенного обнаружения генов транспортной РНК в геномной ДНК. Nucleic Acids Res. 25 , 955–964 (1997).

          CAS Статья Google ученый

        ПРОЦЕДУРЫ ОТБОРА ОБРАЗЦОВ НА ТБ — Служба здравоохранения и социального обеспечения штата Делавэр

        
        

        Mycobacterium tuberculosis , организм, ответственный за туберкулез (ТБ), является основной проблемой общественного здравоохранения в Соединенных Штатах. Однако с увеличением числа бездомных, употребления инъекционных наркотиков и появлением ВИЧ-инфицированных пациентов во многих районах страны произошло значительное увеличение как туберкулезных, так и нетуберкулезных микобактериальных заболеваний (НТМ).

        DE Public Health Lab обслуживает штат Делавэр в качестве справочного центра для выявления и / или тестирования чувствительности M. tuberculosis и другие изоляты микобактерий. Быстрые методы, рекомендованные CDC для сокращения времени обработки диагнозов ТБ, а также специальные методы идентификации, необходимые для нетуберкулезных видов Mycobacterium, могут оказаться неприменимыми в местных лабораториях.

        
        

        ПРЕДЛАГАЕМЫЕ ИСПЫТАНИЯ

        • Мазок на кислотоустойчивые бактерии (AFB)
        • Культура для AFB
        • Идентификация AFB
        • Тестирование чувствительности к противомикробным препаратам
        • Особые запросы и обработка справок
        
        

        СБОР, ОБРАЩЕНИЕ И ОТПРАВКА ОБРАЗЦОВ

        1. Приобретите расходные материалы, заказав отдельные компоненты со склада этой лаборатории.Расходные материалы можно получить, связавшись с заказы в лабораторию, по факсу или по электронной почте [email protected].
        2. Заполните форму заявки на тестирование, включая информацию о пациенте или запрос онлайн. через нашу Систему управления лабораторной информацией (LIMS). Образцы и формы должны быть размещены в специально отведенном месте на каждом участке. для курьера лаборатории, чтобы забрать.
        3. Возьмите образец в соответствии с указаниями, перечисленными ниже.
        4. Пометьте каждый контейнер уникальным идентификатором пациента, именем и датой получения в соответствии с формой заявки. Убедитесь, что крышка плотно закрыта контейнером и упакована отдельно.
        5. Поместите образец и форму заявки, если необходимо, в пакет для биологических опасностей для транспортировки в лабораторию.Убедитесь, что образец запечатан. внутри двойного мешка, а форма вставляется во внешний карман, отделенный от самого образца. Доставка в лабораторию курьерской службой. ДЕЛАТЬ НЕ по почте.

        МАТЧА (ОТХРАННАЯ)

        Необходимо предоставить три образца, полученные ранним утром в разные дни.Достаточно объема от 5 до 10 мл, и нет преимущество в сборе большего объема. Образец должен содержать недавно выделившийся материал из бронхиального дерева с минимальными затратами. содержание слюны.

        МАТЧА (ВЫВЕДЕННАЯ)

        Если у пациента возникают трудности с получением образца мокроты, следует рассмотреть возможность индукции.Производство мокроты может быть вызвано вдыхание теплого аэрозоля стерильного 5-10% хлорида натрия в воде, производимого небулайзером.

        Образец должен иметь четкую пометку «INDUCED» на бланке запроса, так как распыленная мокрота имеет водянистую консистенцию и может быть ошибочно принимают за слюну.

        ПРОМЫВАНИЕ ЖЕЛУДКА

        Эту процедуру можно использовать, когда не удается получить мокроту.Эта техника требует профессионального внимания и должна покушение в больнице. Промывание желудка проводят рано утром перед едой и не менее чем через 8 часов после того, как пациент ел или принимал пероральные препараты. Требуется образец объемом 5-10 мл, который необходимо нейтрализовать 100 мг карбоната натрия.

        МОЧА

        Образец из середины ручья следует собирать рано утром.Отправьте образец целиком. Для получить положительный образец. Из-за загрязнения и порчи образцы мочи за 24 часа НЕ принимаются. Хранить образец в холодильнике до транспортировки.

        КРОВЬ

        Образцы следует собирать в изоляторные пробирки, которые можно получить по запросу в комнате с наборами этой лаборатории.Проверьте срок годности до кровь. Храните пробирки при комнатной температуре. Транспортировать в тот же день сбора.

        ЖИДКОСТИ

        Биологические жидкости (спинномозговые, плевральные, перикардиальные, синовиальные, асцитические, кровь, гной и костный мозг) должны быть собраны в асептических условиях и отправлены в стерильные контейнеры. Хранить в холодильнике до транспортировки.

        ТКАНЬ

        Любую ткань для культивирования необходимо собрать в асептических условиях в стерильный контейнер без фиксаторов и консервантов. Если образец может высушите, добавьте стерильный физиологический раствор, чтобы он оставался влажным. Не помещайте образец ткани для культивирования в формалин. Хранить в холодильнике до транспортировки.

        ИЗОЛЯЦИИ ИЛИ КУЛЬТУРЫ ДЛЯ ИДЕНТИФИКАЦИИ И / ИЛИ УСТОЙЧИВОСТИ

        Изоляты должны быть представлены в виде чистых свежих субкультур на средах Миддлбрука 7h20 или Левенштейна-Йенсена, когда это возможно, но приемлемы жидкие патентованные бульоны 7H9 (т.е. MGIT или флакон BacT / Alert MP). Включите предварительную идентификацию в форму заявки на тестирование. Если направление в CDC является вероятным или специально запрошенным, образец должен сопровождаться заполненной черточкой CDC.

        
        

        ИСПЫТАНИЯ

        Эта лаборатория использует систему Bactec MGIT 960 TB для обнаружения AFB в образцах и проведения тестов на чувствительность.

        Прямая идентификация из прямых образцов (т. Е. Из легких), а также из выращенных культур (бульон или выращенные изоляты) выполняется с помощью лабораторно разработанного теста (LDT) с использованием полимеразной цепной реакции в реальном времени (qPCR).

        Обычная восприимчивость применима только к M. tuberculosis complex (Mtbc).

        Первичное тестирование лекарственной чувствительности (ТЛЧ): изониазид, рифампицин, этамбутол, пиразинамид проводится в DPHL (при необходимости).Панели вторичных препаратов или быстрое первичное ТЛЧ направляются в лабораторию по изучению микробных заболеваний CA (MDL) или CDC, когда это необходимо или требуется.

        Тесты, требующие дополнительных специализированных методов, могут быть отнесены к CDC или CA MDL.

        
        

        ПОЛУЧЕННЫЕ РЕЗУЛЬТАТЫ

        В соответствии с рекомендациями CDC по уменьшению распространения M.tuberculosis, эта лаборатория предоставляет следующие результаты AFB:

        1. Флуоресцентное кислотостойкое окрашивание исходного образца: 24–72 часа с момента поступления в лабораторию.
        2. Идентификация M. tuberculosis в культуре: как можно скорее, но в течение 14-21 дней с момента получения образца.
        3. Результаты восприимчивости для M.tuberculosis : как можно скорее, но в течение 15-30 дней с момента получения образца.

        ПРИМЕЧАНИЕ. Все положительные результаты будут считаться в тот же день обнаружения.

        
        

        ОТКАЗ

        Образцы будут отклонены, если они:

        • Без надписи — все образцы ДОЛЖНЫ иметь уникальный идентификатор пациента.
        • Не указана дата получения
        • Недостаточно количества — Образец не получен, образец в контейнере или образец недостаточен для проведения испытания.
          • Мокроты, содержащие
          • Моча с
        • Damaged — Образец протек или сломался во время транспортировки.
        • Too Old — Образцы старше 3 дней являются ненадежными образцами для тестирования.
        • Contaminated — Изоляты или субкультуры будут отклонены, если невозможно выделить тестовый организм.

        Вернуться на страницу «Выполненные тесты».
        Вернуться на страницу Лаборатории общественного здравоохранения Делавэра

        Обратите внимание: некоторые файлы, доступные на этой странице, находятся в формате Adobe PDF, для которого требуется Adobe Acrobat Reader.Бесплатную копию Adobe Acrobat Reader можно загрузить прямо с Adobe. Если вы используете вспомогательную технологию и не можете читать Adobe PDF, просмотрите соответствующую текстовую версию (если она доступна) или посетите страницу Adobe Accessibility Tools.

        Туберкулез | Национальное географическое общество

        Туберкулез (ТБ) — это древняя болезнь, поражавшая людей эпохи неолита, древних египтян и древних греков и до сих пор имеющая широкие последствия. До начала 20 века туберкулез был основной причиной смерти в Европе и Северной Америке.В то время инфицированные были изолированы в санаториях, местах, куда больных отправляли отдыхать и выздоравливать. Разработка антибиотиков в 1940-х годах означала, что туберкулез можно лечить более эффективно.

        Туберкулез вызывается бактериями, известными как Mycobacterium tuberculosis . Заболевание характеризуется поражением легких. Больные туберкулезом откашливаются с кровью и слизью, теряют вес, теряют аппетит, жар, утомляемость и ночную потливость.Это серьезное заболевание может привести к летальному исходу и является одной из основных причин смерти во всем мире.

        При заражении бактерии туберкулеза распространяются в легких и образуют узелки, которые разрушают респираторные ткани, создавая дыры в легких. Бактерии также разрушают кровеносные сосуды, вызывая откашливание крови. Хотя туберкулез наиболее известен своим воздействием на легкие, болезнь может поражать и другие органы, такие как почки, позвоночник и мозг.

        Человек, инфицированный туберкулезом, может распространять бактерии по воздуху, когда кашляет или чихает.Некоторые люди могут переносить болезнь, не проявляя никаких симптомов и не будучи заразной — это известно как латентная туберкулезная инфекция. Четверть людей, живущих с туберкулезом во всем мире, имеют скрытую инфекцию.

        ТБ эндемичен для некоторых регионов мира, таких как Африка, Россия, Восточная Европа, Азия, Латинская Америка и Карибский бассейн. Именно в этих областях наиболее высока вероятность заражения болезнью. В развивающихся странах уровень заболеваемости туберкулезом намного выше, чем в развитых странах. Детей в развитых странах часто вакцинируют вакциной против бациллы Кальметта-Герена (БЦЖ).Однако эта вакцина неэффективна для взрослых.

        Определенные факторы, такие как употребление табака и наркотиков, повышают риск заражения туберкулезом. Работа или проживание в окружении людей с повышенным риском туберкулеза также увеличивает потенциальное воздействие бактерий. Люди с ослабленной иммунной системой с большей вероятностью заразятся туберкулезом. В 1980-х годах заболеваемость туберкулезом в развитых странах росла из-за появления ВИЧ / СПИДа, ослабляющего иммунную систему. По сей день туберкулез является основной причиной смерти среди ВИЧ-инфицированных.

        Туберкулез диагностируется с помощью кожных и анализов крови, а также рентгеновских лучей. Лечение туберкулеза — длительный процесс, часто требующий нескольких месяцев и большого количества лекарств. После успешного лечения человек, скорее всего, больше не заразен. Изониазид и рифампицин — два широко используемых антибиотика.

        К сожалению, некоторые штаммы туберкулеза устойчивы к антибиотикам. Устойчивость к антибиотикам развивается, когда антибиотик не может убить все бактерии, что может произойти, когда курс антибиотиков не завершен, а выжившие бактерии размножаются и передают устойчивость.Помимо того, что бактерии стали устойчивыми к широко используемым антибиотикам, они даже стали устойчивыми к некоторым из менее широко используемых методов лечения, что еще больше затрудняет их лечение.

        Микробиота мокроты при туберкулезе, выявленная пиросеквенированием 16S рРНК

        Аннотация

        Фон

        Туберкулез (ТБ) остается глобальной угрозой в 21 веке. Традиционные исследования болезни сосредоточены на единственном возбудителе Mycobacterium tuberculosis .Недавние исследования выявили связь некоторых заболеваний с дисбалансом микробного сообщества. Характеристика микробиоты туберкулеза может позволить лучше понять болезнь.

        Методология / основные выводы

        Здесь микробиота мокроты при туберкулезной инфекции была исследована с помощью пиросеквенирования 16S рРНК. Всего было произведено 829 873 считывания высококачественного секвенирования из 22 ТБ и 14 контрольных образцов мокроты. Firmicutes , Proteobacteria , Bacteroidetes , Actinobacteria и Fusobacteria были пятью основными выделенными типами бактерий, которые вместе составляют более 98% микробного сообщества. Proteobacteria и Bacteroidetes были больше представлены в образцах TB, а Firmicutes преобладали в контрольных образцах. Выявлено шестнадцать основных родов бактерий. Streptococcus , Neisseria и Prevotella были наиболее преобладающими родами, в которых преобладали несколько операционных таксономических единиц, сгруппированных на уровне сходства 97%. Actinomyces , Fusobacterium , Leptotrichia , Prevotella , Streptococcus и Veillonella были обнаружены во всех образцах ТБ, возможно, представляя основные роды микробиоты мокроты ТБ.Менее представленные роды Mogibacterium , Moryella и Oribacterium были статистически обогащены в образцах TB, в то время как род, принадлежащий к неклассифицированным Lactobacillales , был обогащен в контроле. Разнообразие микробиоты было одинаковым в туберкулезной и контрольной пробах.

        Выводы / Значение

        Состав и разнообразие микробиоты мокроты при туберкулезной инфекции были впервые охарактеризованы с помощью высокопроизводительного пиросеквенирования.Он закладывает основу для изучения потенциальной роли, которую играет разнообразная микробиота в патогенезе и прогрессировании ТБ, и в конечном итоге может способствовать прогрессу в лечении ТБ.

        Образец цитирования: Cheung MK, Lam WY, Fung WYW, Law PTW, Au CH, Nong W, et al. (2013) Микробиота мокроты при туберкулезе, выявленная пиросеквенированием 16S рРНК. PLoS ONE 8 (1): e54574. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054574

        Редактор: Стефан Бересвилл, Медицинский университет Шарите в Берлине, Германия

        Поступила: 24.10.2012; Одобрена: 12 декабря 2012 г .; Опубликован: 24 января 2013 г.

        Авторские права: © 2013 Cheung et al.Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.

        Финансирование: Эта работа была поддержана Исследовательским фондом по борьбе с инфекционными заболеваниями (RFCID) Управления здравоохранения, социального обеспечения и питания правительства САР Гонконг (Ref. No. 0

        42). Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.

        Конкурирующие интересы: Авторы заявили об отсутствии конкурирующих интересов.

        Введение

        Туберкулез (ТБ) — это воздушно-капельное инфекционное заболевание, вызываемое бактерией Mycobacterium tuberculosis . По оценкам, в 2010 году во всем мире было зарегистрировано 8,5 миллиона случаев туберкулеза, в результате чего 1,2 миллиона человек умерли [1]. Глобальная борьба с туберкулезом опирается на 90-летнюю и в значительной степени неэффективную вакцину Бациллы Кальметта-Герена (БЦЖ) и лекарства, выпущенные несколько десятилетий назад [2].Растущие эпидемии ВИЧ / СПИДа и штаммов туберкулеза с множественной лекарственной устойчивостью еще больше усложнили эффективность борьбы с болезнями [3]. Как и в большинстве классических исследований болезни, исследования туберкулеза были сосредоточены на одном возбудителе. Однако недавние исследования позволяют предположить, что фенотипы заболеваний с большей вероятностью являются результатом сложных микробных взаимодействий [4]. Характеристика целых микробных сообществ при туберкулезе может дать более полное представление о болезни.

        Появление независимой от клонирования и массово параллельной технологии пиросеквенирования 454 [5] облегчило исследования популяций почвенных микробов [6], морских микробных сообществ [7] и микробиоты кишечника человека [8].Совсем недавно микробиота респираторных заболеваний, таких как муковисцидоз (МВ) [9], [10], хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ) [11] и нозокомиальная пневмония [12], также была охарактеризована с использованием этого подхода. Выявляя состав и разнообразие микробиоты, связанной с этими заболеваниями, эти исследования позволяют развивать гипотезы, связывающие микробные сообщества и болезненные состояния. Информация о респираторной микробиоте при туберкулезной инфекции в настоящее время недоступна.Здесь, на основе пиросеквенирования 16S рРНК, впервые исследованы состав и разнообразие микробиоты мокроты при туберкулезной инфекции. Для сравнения также была охарактеризована микробиота образцов мокроты, не соответствующих туберкулезу.

        Результаты

        Всего в этом исследовании было получено 964 556 необработанных чтений 16S рРНК. Около 578000 считываний были из 22 образцов ТБ, а оставшиеся ~ 387000 считываний были из 14 контрольных (таблица 1). В процессе фильтрации было удалено около 14% необработанных считываний секвенирования.Было произведено около 499 000 и 331 000 высококачественных считываний образцов для туберкулеза и контрольных образцов соответственно. Средняя длина считывания после удаления последовательностей праймеров составляла около 370 п.н. Среднее количество квалифицированных чтений для группы ТБ было 22 660, а для контрольной группы — 23 667. Если увеличить количество считываний до 13 210, то мы получим в среднем 486 и 487 OTU в TB и контрольной выборке, соответственно. Среднее вычисленное значение Chao1 составило 832 в образцах TB и 870 в контроле.Средний индекс Шеннона составил 4,85 в образцах ТБ и 4,80 в контроле.

        Firmicutes , Proteobacteria , Bacteroidetes , Actinobacteria и Fusobacteria были основными выделенными типами бактерий, которые вместе составляли более 98% микробного сообщества (рис. 1). Firmicutes , Proteobacteria и Bacteroidetes были среди наиболее распространенных типов как в ТБ, так и в контрольных образцах, составив 37.6%, 31,2% и 19,2% в образцах ТБ и 43,6%, 27,1% и 17,0% в контроле соответственно. В то время как относительная численность Actinobacteria и Fusobacteria между двумя группами была схожей, Proteobacteria и Bacteroidetes были больше представлены в образцах TB, а Firmicutes преобладали в контроле. Разбивка данных выявила большие различия в структуре сообщества среди людей (рис. 2). Это было подтверждено анализом PCoA, в котором не наблюдалось явной дифференциальной кластеризации между членами ТБ и контрольной группы (рис. 3).

        Рис. 2. Относительная численность доминирующих бактериальных филумов у всех исследуемых особей.

        Были включены только типы> 1% в каждой группе. 22 образца слева были от больных туберкулезом, а 14 образцов справа — от контрольной группы.

        https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054574.g002

        Рис. 3. Графики PCoA ТБ и контрольных образцов.

        Графики основаны на а) взвешенных и б) невзвешенных расстояниях UniFrac.Две основные координаты вместе объяснили 66,44% и 24,31% вариаций во взвешенном и невзвешенном случаях, соответственно. Красные точки представляют образцы ТБ; синие точки представляют собой контрольные образцы.

        https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054574.g003

        Шестнадцать основных родов бактерий были обнаружены в образцах мокроты здесь (Рисунок 4). Самыми многочисленными родами в выборках TB были Neisseria (28,0%), Streptococcus (27,8%) и Prevotella (16.8%), тогда как для контроля были Streptococcus (31,8%), Neisseria (22,0%) и Prevotella (14,4%). Neisseria и Prevotella были больше представлены в образцах ТБ, а Streptococcus преобладали в контрольных образцах. Lactococcus , Pseudomonas и неклассифицированные Enterobacteriaceae были менее доминирующими и преобладающими в образцах ТБ (рисунки 4 и 5). В пределах 16 основных родов только Actinomyces , Fusobacterium , Leptotrichia , Prevotella , Streptococcus и Veillonella были обнаружены во всех образцах TB, и все эти роды, кроме Leptotrichia , были обнаружены в все 36 образцов (рис. 5).Разбивка данных снова выявила различия между членами в структуре сообщества на уровне родов (рис. 6).

        Рис. 6. Относительная численность доминантных родов бактерий у всех исследуемых особей.

        Были включены только роды> 1% в каждой группе. 22 образца слева были от больных туберкулезом, а 14 образцов справа — от контрольной группы.

        https://doi.org/10.1371/journal.pone.0054574.g006

        Две OTU вместе составили более 90% доминантного рода Neisseria в обеих группах выборки (таблица 2).OTU 6783 был наиболее похож на некультивируемый клон NSV3Q1b18, взятый из тампона для душа [13], и составлял 57,2% и 88,7% от рода в TB и контрольной выборке, соответственно. С другой стороны, OTU 7988 был наиболее похож на некультивируемый клон 7H59 из поддесневой бляшки пациента без пародонтита [14], и он был больше представлен у Neisseria в образцах TB (37,4%), чем в контроле. (4,1%). Около одной трети другого основного рода Streptococcus была представлена ​​тремя OTU в обеих группах выборки (таблица 2).OTU 1734 был наиболее похож на клон S. mitis , взятый из ротовой полости [15], и был больше представлен в Streptococcus в образцах ТБ (12,0%), чем в контроле (1,6%). С другой стороны, OTU 6370 был наиболее похож на клон S. parasanguinis , взятый из ротовой полости, и был больше представлен в контрольных образцах (16,3%), чем в образцах TB (5,6%). OTU 7204 был наиболее похож на штамм S. salivarius ATCC 7073, и его вклад в род был относительно сопоставимым в обеих группах (12.4% по туберкулезу и 14,6% по контролю). Две OTU вместе составили более одной трети рода Prevotella как в TB, так и в контрольной выборке (Таблица 2). Они были наиболее похожи на некультивируемые бактериальные клоны, взятые из ротовой полости человека.

        Что касается менее представленных таксонов, роды Moryella , Mogibacterium и Oribacterium были статистически обогащены в образцах TB ( p <0,05), тогда как род, принадлежащий к неклассифицированным Lactobacillales , был обогащен контрольные образцы ( p <0.05) (таблица 3). На уровне видов восемь ОТЕ, включая те, которые на 99% идентичны Prevotella melaninogenica , Lactobacillus crispatus , Streptococcus anginosus и Parvimonas micra , были обнаружены обогащенными в образцах ТБ ( p <0,05). . Две другие OTU, включая одну, на 99% идентичную Aggregatibacter aphrophilus , были обогащены контрольными образцами ( p <0,05) (таблица 3).

        Обсуждение

        ТБ остается глобальной угрозой в 21 веке.Партнерство «Остановить туберкулез», возглавляемое Всемирной организацией здравоохранения, планирует сократить вдвое глобальную распространенность туберкулеза и смертность от него к 2015 году и ликвидировать это заболевание как проблему общественного здравоохранения к 2050 году [16]. Лучшее понимание болезни под углом, отличным от традиционного подхода на основе одного патогена, могло бы помочь в достижении этих целей. Действительно, вместо наличия одного патогена, вызывающего заболевание, было показано, что некоторые заболевания связаны с дисбалансом в микробном сообществе и могут возникать в результате дисбаланса, известного как дисбактериоз.Воспалительное заболевание кишечника [17] и ожирение [18] — два хорошо известных примера. Появление технологий секвенирования следующего поколения, таких как пиросеквенирование 454, значительно продвинуло исследования микробиоты человека [19]. Однако, в отличие от широко изученной микробиоты кишечника, исследование микробиоты, связанной с легкими, является относительно новым [20]. В этом исследовании микробиота мокроты при туберкулезной инфекции была охарактеризована с помощью пиросеквенирования 16S рРНК, впервые направленного на углубление понимания болезни на уровне микробного сообщества.

        В этом исследовании было получено около одного миллиона считываний сырых секвенирований для 36 образцов мокроты. Однако пропускной способности по-прежнему недостаточно для захвата каждого члена микробного сообщества. Особенно заслуживает упоминания пример M. tuberculosis . M. tuberculosis , хотя и является возбудителем заболевания, составляет лишь очень небольшую часть всей микробиоты в образцах мокроты ТБ (рис. 4). Для получения положительных результатов в посевах и мазках должно быть не менее 100 M.tuberculosis клеток / мл и ∼10 ⁴ кислотоустойчивых бацилл / мл соответственно [21]. Поскольку средняя общая бактериальная нагрузка в образцах мокроты может достигать 10 ⁹ клеток / мл [22], может потребоваться 10 ⁵ считываний для восстановления однократного считывания M. tuberculosis в конкретном образце ТБ. Поскольку средняя производительность секвенирования здесь была <27000 считываний на образец, неудивительно, что в некоторых образцах мокроты ТБ не было обнаружено никаких считываний M. tuberculosis .Тем не менее, производительность секвенирования достаточна для выявления основных типов и родов микробиоты мокроты и позволяет проводить значимые сравнения между туберкулезными и контрольными группами.

        В образцах мокроты, собранных в этом исследовании, были обнаружены пять основных бактериальных типов; это были Firmicutes , Proteobacteria , Bacteroidetes , Actinobacteria и Fusobacteria . Они также являются преобладающими типами в других частях тела человека, включая ротовую полость, кожу и толстую кишку [19].Кроме того, они доминируют в микробиоте мокроты при МВ [10] и бронхиальном тракте пациентов с ХОБЛ [11]. Три наиболее доминирующих типа, выявленные в этом исследовании ( Firmicutes , Proteobacteria и Bacteroidetes ), также являются наиболее часто определяемыми типами в нормальной микробиоте легких [20]. Все вместе они предполагают преобладание этих основных типов в нормальной и больной микробиоте легких, а также в микробиоте человека в целом. Среди 16 основных родов, восстановленных в этом исследовании, только Actinomyces , Fusobacterium , Leptotrichia , Prevotella , Streptococcus и Veillonella были обнаружены во всех образцах TB, и они могут представлять основные роды. в микробиоте туберкулезной мокроты.Точно так же, за исключением Leptotrichia , остальные пять родов были обнаружены во всех 36 образцах, и они могут представлять основные роды микробиоты мокроты в целом. Однако для подтверждения этого необходимы дополнительные исследования.

        Streptococcus , Neisseria и Prevotella были тремя наиболее преобладающими родами, выделенными в образцах мокроты, собранных в данном исследовании. Они также являются основными родами, обнаруженными в мокроте пациентов с ХОБЛ [11], нозокомиальной пневмонией [12] и МВ [9], [10].Это контрастирует с нормальной микробиотой легких, в которой доминирует род Pseudomonas [20]. Род Streptococcus включает как комменсальные, так и патогенные грамположительные бактерии, населяющие различные участки тела человека, включая ротовую полость и верхние дыхательные пути. Streptococcus pneumoniae , например, хорошо известный патоген, связанный с пневмонией [23]. Neisseria — группа грамотрицательных бактерий, колонизирующих эпителий слизистой оболочки человека.Комменсальные виды включают N. lactamica и N. mucosa , тогда как патогенные виды, такие как N. meningitidis , могут вызывать пневмонию [24]. Prevotella содержит облигатные анаэробы, обычно выделяемые из полости рта и кишечника человека, и может вызывать инфекции нижних дыхательных путей. Считается, что представители этого рода вызывают легочные обострения из-за полимикробных взаимодействий, которые усиливают вирулентность установленных патогенов [25].

        В каждом из трех наиболее преобладающих родов доминировали от двух до трех основных OTU, которые вместе составляли от одной трети до 90% групп. OTU 1734 из рода Streptococcus на 100% идентичен S. mitis и был больше представлен в Streptococcus в образцах TB, чем в контроле. Хотя обычно это комменсал, S. mitis может стать значительным патогеном у пациентов с ослабленным иммунитетом, а также у лиц, вовлеченных в широкий спектр заболеваний, включая пневмонию [26].Действительно, исследование генома штамма S. mitis B6 выявило гомологи многих ранее идентифицированных факторов вирулентности S. pneumoniae , таких как автолизины [27]. Также сообщалось, что инкубация S. mitis в эпителиальных клетках десны индуцирует экспрессию человеческого β-дефенсина 2, который может убивать другие оральные патогены [28]. Таким образом, разумно предположить, что повышенное относительное количество условно-патогенных микроорганизмов при инфекциях ТБ может изменить микробное сообщество в легких ТБ и повлиять на патогенез и прогрессирование ТБ.В отличие от OTU 1734, OTU 6370, который на 100% идентичен S. parasanguinis , был больше представлен в контрольных образцах. S. parasanguinis является представителем стрептококков viridans, которые составляют основную популяцию микробиоты полости рта человека. Он также является одним из первых колонизаторов поверхности зубов [29]. OTU 7204 наиболее сходен с S. salivarius и имел относительно сопоставимую численность у Streptococcus в обеих группах. Хотя S.salivarius обычно вызывает бактериемию [30]. Две доминантные OTU Neisseria и две доминирующие OTU Prevotella наиболее похожи на некультивируемые клоны с ограниченной информацией. Дополнительные исследования этих организмов призваны лучше понять потенциальное влияние этих многочисленных членов на туберкулез или микробиоту мокроты.

        Менее распространенные таксоны также могут влиять на динамику микробного сообщества и клинические исходы [31]. Роды Mogibacterium , Moryella и Oribacterium были статистически обогащены в образцах ТБ, собранных в этом исследовании. Mogibacterium — это группа грамположительных анаэробных бактерий, представители которой, такие как M. timidum , были идентифицированы в случаях острых легочных инфекций [32]. С другой стороны, Moryella и Oribacterium — это роды анаэробных бактерий, которые были идентифицированы в последнее десятилетие [33], [34]. С момента их открытия мало информации. На уровне видов было обнаружено, что восемь менее представленных OTU значительно обогащены в выборках TB, каждая с более чем 10-кратной разницей в относительной численности между группами выборки.Четыре из них имеют высокое сходство (99%) с известными видами бактерий, включая Prevotella melaninogenica , Lactobacillus crispatus , Streptococcus anginosus и Parvimonas micro . P. melaninogenica — грамотрицательная анаэробная бактерия, которая является повсеместным членом комменсальной микробиоты полости рта. Однако о предполагаемых факторах вирулентности, таких как гемагглютинация, сообщалось у некоторых штаммов [35]. Лактобациллы — это грамположительные бактерии, которые обычно считаются полезными для здоровья человека.Однако было обнаружено, что штамм M206119 L. crispatus усугубляет вызванный декстрансульфатом натрия (DSS) колит у мышей, препятствуя их воспалительным реакциям у мышей [36]. Сообщалось, что инфекций S. anginosus могут симулировать туберкулез [37]. Действительно, ранее сообщалось о трех случаях коинфекции S. anginosus и M. tuberculosis [38]. P. micra — грамположительный анаэроб, обычно выделяемый из ротовой полости человека.Однако ранее сообщалось о связи бактерии с инфекциями дыхательных путей и желудочно-кишечного тракта [39]. Обогащение этих условно-патогенных микроорганизмов в мокроте ТБ, выявленное здесь, предполагает их связь с патогенезом или прогрессированием ТБ.

        Было обнаружено, что разнообразие бактериального сообщества в мокроте при МВ положительно коррелирует со стабильностью пациента [9], [36]. Также сообщалось, что уменьшение микробного разнообразия в желудочно-кишечном тракте связано с увеличением частоты воспалительных заболеваний кишечника [40].Однако было обнаружено, что бактериальное разнообразие среди пациентов с астмой значительно выше, чем в контрольной группе [41]. В нашем исследовании микробное разнообразие оказалось одинаковым в образцах туберкулеза и контрольной мокроты. Таким образом, похоже, не существует общей взаимосвязи между микробным разнообразием и болезненным состоянием. В самом деле, это не является неожиданным, потому что разные заболевания могут включать разные наборы микробиоты, внутри которых взаимодействия могут быть сложными, включая как синергетические, так и антагонистические эффекты между членами [42].

        Настоящее исследование представляет собой первую характеристику микробиоты мокроты при туберкулезной инфекции на основе пиросеквенирования 16S рРНК. Эта работа позволит в будущем изучить потенциальную роль разнообразной микробиоты в патогенезе и прогрессировании туберкулеза и в конечном итоге может способствовать прогрессу в лечении туберкулеза. Однако необходимы дополнительные исследования некультивируемых таксонов. Ожидается, что дальнейшие исследования, основанные на метатранскриптомике, метапротеомике и метаболомике на уровнях РНК, белков и метаболитов, соответственно, также дадут более глубокое понимание этого заболевания.

        Материалы и методы

        Заявление об этике

        Исследование было одобрено Объединенным комитетом по этике клинических исследований CUHK-NTEC при больнице принца Уэльского в Гонконге. Письменное информированное согласие было получено от всех исследуемых субъектов на сбор образцов и последующий анализ.

        Сбор образцов и извлечение ДНК

        Образцы мокроты были собраны в Справочной лаборатории по туберкулезу при правительстве Гонконга в рамках обычного скрининга на ТБ.Все образцы в этом исследовании были получены от пациентов, являющихся этническими китайцами из Гонконга. Все пациенты не были инфицированы ВИЧ. Пациентам не давали никаких противотуберкулезных или других антибиотиков в течение четырех недель после сбора мокроты. Образцы мокроты с положительным мазком и посевом были собраны у 22 пациентов (13 мужчин и 8 женщин в возрасте от 20 до 66 лет; данные по одному пациенту отсутствуют) (таблица 1, набор данных S1). Контрольные образцы мокроты были также собраны у 14 человек (шесть мужчин и восемь женщин в возрасте от 22 до 82 лет) с симптомами кашля, напоминающими туберкулез, но с отрицательными посевами для сравнения.Образцы мокроты обрабатывали 3% -ным раствором NaOH, нейтрализовали фосфатным буфером и затем центрифугировали. Примерно 200 мкл супернатанта подвергали экстракции геномной ДНК с использованием набора QIAamp DNA Mini Kit ( Qiagen , Valencia, CA, USA).

        ПЦР и пиросеквенирование

        ПЦР выполняли с использованием составных праймеров, фланкирующих гипервариабельную область V1 – V2 гена 16S рРНК: A-8F (5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3 ‘) и B-357R (5′-CTGCTGCCTYCCGTA-3′) [43]. Адаптеры для секвенирования и специфичные для образца мультиплексные идентификаторы (MID) также добавляли к 5’-концам праймеров в соответствии с протоколом производителя.Реакции ПЦР проводили с использованием набора Platinum® PCR SuperMix High Fidelity Kit ( Invitrogen , Carlsbad, CA, USA ). Термический режим ПЦР состоял из начальной денатурации 30 с при 94 ° C, затем 28 циклов по 30 с при 94 ° C, 30 с при 55 ° C и 40 с при 68 ° C. Продукты ПЦР очищали с помощью набора для очистки MinElute PCR Purification Kit ( Qiagen , Валенсия, Калифорния, США), а качество очищенных продуктов оценивали с помощью Agilent Bioanalyzer 2100. Пиросеквенирование очищенных продуктов ПЦР выполняли в одном направлении от A- 8F и на платформе GS FLX-Titanium за один проход по всей пластине.Данные секвенирования были отправлены в архив короткого чтения NCBI (инвентарный номер SRA058505).

        Анализ данных

        необработанных считываний секвенирования были демультиплексированы, отфильтрованы по качеству и проанализированы с использованием QIIME 1.4.0 [44]. Вкратце, считывания короче 200 пар оснований или длиннее 1000 пар оснований, со средней оценкой качества ниже 25 в скользящем окне 50 пар оснований, с несовпадающими последовательностями праймеров или с неоднозначными основаниями (Ns) были удалены из последующих анализов. Отфильтрованные по качеству чтения были сгруппированы в операционные таксономические единицы (OTU) со сходством 97%.Таксономическое назначение репрезентативных OTU было выполнено с использованием классификатора RDP [45] с доверительным порогом 0,8 по сравнению с основным набором Greengenes [46]. Набор данных был сокращен до расчета альфа-разнообразия. Анализ главных координат (PCoA) проводился с использованием взвешенных и невзвешенных расстояний UniFrac [47]. Статистический анализ проводился с использованием SAS.

        Вклад авторов

        Задумал и спроектировал эксперименты: WYWF HSK SKWT. Проведены эксперименты: WYWF PTWL.Проанализированы данные: MKC WYL CHA WN. Внесенные реактивы / материалы / инструменты анализа: KMK. Написал статью: MKC WYL.

        Ссылки

        1. 1. ВОЗ (2011 г.) Глобальная борьба с туберкулезом: отчет ВОЗ за 2011 г. Доступно: http://www.who.int/tb/publications/global_report/en/index.html. По состоянию на 24 октября 2012 г.
        2. 2. Young DB, Perkins MD, Duncan K, Barry CE 3 ^rd (2008) Противодействие научным препятствиям на пути глобального контроля над туберкулезом. Дж. Клин Инвест 118: 1255–1265.
        3. 3. Comas I, Gagneux S (2009) Прошлое и будущее исследований туберкулеза. PLoS Pathog 5: e1000600.
        4. 4. Клементе Дж. К., Урселл Л. К., Парфри Л. В., Найт Р. (2012) Влияние микробиоты кишечника на здоровье человека: комплексный взгляд. Cell 148: 1258–1270.
        5. 5. Маргулис М., Эгхолм М., Альтман В.Е., Аттия С., Бадер Дж. С. и др. (2005) Секвенирование генома в микроизготовленных пиколитровых реакторах высокой плотности. Природа 437: 376–380.
        6. 6.Palmer K, Biasi C, Horn MA (2012) Контрастные сообщества денитрификаторов связаны с контрастирующими структурами выбросов N ₂ O из кислых торфяных почв в арктической тундре. ISME J 6: 1058–1077.
        7. 7. Cheung MK, Au CH, Chu KH, Kwan HS, Wong CK (2010) Состав и генетическое разнообразие пикоэукариот в субтропических прибрежных водах, выявленные с помощью 454 пиросеквенирования. ISME J 4: 1053–1059.
        8. 8. Saulnier DM, Riehle K, Mistretta TA, Diaz MA, Mandal D, et al.(2011) Сигнатуры желудочно-кишечного микробиома педиатрических пациентов с синдромом раздраженного кишечника. Гастроэнтерология 141: 1782–1791.
        9. 9. Филкинс Л.М., Хэмптон Т.Х., Гиффорд А.Х., Гросс М.Дж., Хоган Д.А. и др. (2012) Распространенность стрептококков и увеличение полимикробного разнообразия, связанное с устойчивостью пациентов с муковисцидозом. J Bacteriol 194: 4709–4717.
        10. 10. Guss AM, Roeselers G, Newton IL, Young CR, Klepac-Ceraj V, et al. (2011) Филогенетическое и метаболическое разнообразие бактерий, связанных с муковисцидозом.ISME J 5: 20–29.
        11. 11. Кабрера-Рубио Р., Гарсия-Нуньес М., Сето Л., Анто Дж. М., Моя А. и др. (2012) Разнообразие микробиома в бронхиальном тракте пациентов с хронической обструктивной болезнью легких. J Clin Microbiol 50: 3562–3568.
        12. 12. Чжоу Ю., Линь П., Ли Кью, Хан Л., Чжэн Х и др. (2010) Анализ микробиоты образцов мокроты от пациентов с инфекциями нижних дыхательных путей. Acta Biochim Biophys Sin (Шанхай) 42: 754–76.
        13. 13. Физел Л. М., Баумгартнер Л. К., Петерсон К. Л., Франк Д. Н., Харрис Дж. К. и др.(2009) Оппортунистические патогены, обогащенные биопленками насадки для душа. Proc Natl Acad Sci U S A 106: 16393–16399.
        14. 14. Ю М., Мо С., Ватт Р. М., Люнг В. К. Распространенность и разнообразие таксонов Synergistetes в здоровье и заболеваниях пародонта. J Periodontal Res. Под давлением.
        15. 15. Дьюхерст Ф.Е., Чен Т., Изард Дж., Пастер Б.Дж., Таннер А.С. и др. (2010) Микробиом ротовой полости человека. J Bacteriol 192: 5002–5017.
        16. 16. Партнерство «Остановить туберкулез» (2011 г.) Глобальный план «Остановить туберкулез» на 2011–2015 гг.Доступно: http://www.stoptb.org/global/plan/. По состоянию на 24 октября 2012 г.
        17. 17. Spor A, Koren O, Ley R (2011) Распознавание эффектов окружающей среды и генотипа хозяина на микробиом кишечника. Nat Rev Microbiol 9: 279–290.
        18. 18. Тернбо П.Дж., Ридаура В.К., Фейт Дж.Дж., Рей Ф.Е., Найт Р. и др. (2009) Влияние диеты на микробиом кишечника человека: метагеномный анализ на гуманизированных мышах-гнотобиотах. Sci Transl Med 1: 6ra14.
        19. 19. Чо И., Блазер MJ (2012) Микробиом человека: на стыке здоровья и болезни.Нат Рев Генет 13: 260–270.
        20. 20. Бек Дж. М., Янг В. Б., Хаффнагл Г. Б. (2012) Микробиом легких. Перевод Рез. 160: 258–266.
        21. 21. Виньеш Р., Балакришнан П., Шанкар Э.М., Муругавел К.Г., Ханас С. и др. (2007) Значение мазков мокроты на однократные кислотоустойчивые бациллы в диагностике туберкулеза у ВИЧ-инфицированных. J Med Microbiol 56: 1709–1710.
        22. 22. Чжао Дж., Шлосс П.Д., Каликин Л.М., Кармоди Л.А., Фостер Б.К. и др. (2012) Десятилетняя динамика бактериального сообщества при муковисцидозе дыхательных путей.Proc Natl Acad Sci U S A 109: 5809–5814.
        23. 23. Nobbs AH, Lamont RJ, Jenkinson HF (2009) Streptococcus приверженность и колонизация. Microbiol Mol Biol Rev 73: 407–450.
        24. 24. Бригам К.С., Сандора Т.Дж. (2009) Neisseria meningitidis : эпидемиология, лечение и профилактика у подростков. Curr Opin Pediatr 21: 437–443.
        25. 25. Field TR, Sibley CD, Parkins MD, Rabin HR, Surette MG (2010) Род Prevotella при муковисцидозе дыхательных путей.Анаэроб 16: 337–344.
        26. 26. Mitchell J (2011) Streptococcus mitis : на грани между комменсализмом и патогенезом. Mol Oral Microbiol 26: 89–98.
        27. 27. Денапайт Д., Брюкнер Р., Нун М., Райхманн П., Генрих Б. и др. (2010) Геном Streptococcus mitis B6 — что такое комменсал? PLoS One 5: e9426.
        28. 28. Eberhard J, Pietschmann R, Falk W, Jepsen S, Dommisch H (2009) Иммунный ответ эпителиальных клеток ротовой полости, индуцированный одновидовыми и сложными естественными биопленками.Устный Microbiol Immunol 24: 325–330.
        29. 29. Geng J, Chiu CH, Tang P, Chen Y, Shieh HR, et al. (2012) Полный геном и транскриптомы Streptococcus parasanguinis FW213: филогенные отношения и потенциальные механизмы вирулентности. PLoS One 7: e34769.
        30. 30. Хан XY, Камана М., Ролстон К.В. (2006) Стрептококки Viridans, выделенные посевом из крови больных раком: клинический и микробиологический анализ 50 случаев. J Clin Microbiol 44: 160–165.
        31. 31. Цинь Дж., Ли Р., Раес Дж., Арумугам М., Бургдорф К.С. и др. (2010) Каталог кишечных микробных генов человека, созданный с помощью метагеномного секвенирования. Природа 464: 59–65.
        32. 32. Hill GB, Ayers OM, Kohan AP (1987) Характеристики и места заражения Eubacterium nodatum, Eubacterium timidum, Eubacterium brachy, и других асахаролитических эубактерий. J Clin Microbiol 25: 1540–1545.
        33. 33. Carlier JP, K’ouas G, Bonne I, Lozniewski A, Mory F (2004) Oribacterium sinus gen.nov., sp. nov., в семействе ‘Lachnospiraceae’ (тип Firmicutes ). Int J Syst Evol Microbiol 54: 1611–1615.
        34. 34. Carlier JP, K’ouas G, Han XY (2007) Moryella indoligenes gen. nov., sp. nov., анаэробная бактерия, выделенная из клинических образцов. Int J Syst Evol Microbiol 57: 725–729.
        35. 35. Haraldsson G, Meurman JH, Könönen E, Holbrook WP (2005) Свойства гемагглютинации с помощью Prevotella melaninogenica .Анаэроб 11: 285–289.
        36. 36. Zhou FX, Chen L, Liu XW, Ouyang CH, Wu XP и др. (2012) Lactobacillus crispatus M206119 усугубляет DSS-колит мышей, препятствуя воспалительным реакциям. Всемирный журнал J Gastroenterol 18: 2344–2356.
        37. 37. Jacobs JA, Pietersen HG, Walenkamp GH, Stobberingh EE, Soeters PB (1994) Межпозвоночная инфекция, вызванная Streptococcus milleri . Отчет о болезни. Clin Orthop Relat Res 302: 183–188.
        38. 38.Rabuñal R, Corredoira J, Monte R, Coira A (2009) Совместная инфекция Streptococcus anginosus и Mycobacterium tuberculosis : три сообщения о случаях. J Med Case Rep 3: 37.
        39. 39. Мердок Д.А., Шах Х.Н. (1999) Реклассификация Peptostreptococcus magnus (Prevot 1933) Holdeman and Moore 1972 как Finegoldia magna comb. ноя и Peptostreptococcus micros (Prevot 1933) Smith 1957 as Micromonas micros comb.ноя Анаэроб 5: 555–559.
        40. 40. Отт С.Дж., Мусфельдт М., Вендерот Д.Ф., Хампе Дж., Брант О. и др. (2004) Уменьшение разнообразия бактериальной микрофлоры слизистой оболочки толстой кишки у пациентов с активным воспалительным заболеванием кишечника. Gut 53: 685–93.
        41. 41. Хуанг YJ, Нельсон CE, Brodie EL, Desantis TZ, Baek MS, et al. (2011) Микробиота дыхательных путей и гиперреактивность бронхов у пациентов с плохо контролируемой астмой. J Allergy Clin Immunol 127: 372–381.
        42. 42. Pédron T, Sansonetti P (2008) Commensals, бактериальные патогены и воспаление кишечника: интригующий ménage à trois. Клеточный микроб-хозяин 3: 344–347.
        43. 43. Маккенна П., Хоффманн С., Минка Н., Ай П.П., Лакнер А. и др. (2008) Микробиом кишечника макака в здоровье, лентивирусной инфекции и хроническом энтероколите. PLoS Pathog 4: e20.
        44. 44. Caporaso JG, Kuczynski J, Stombaugh J, Bittinger K, Bushman FD, et al. (2010) QIIME позволяет анализировать данные секвенирования сообщества с высокой пропускной способностью.Nat Методы 7: 335–336.
        45. 45. Ван Кью, Гаррити Дж. М., Тидже Дж. М., Коул Дж. Р. (2007) Наивный байесовский классификатор для быстрого отнесения последовательностей рРНК к новой бактериальной таксономии. Appl Environ Microbiol 73: 5261–5267.
        46. 46. ДеСантис Т.З., Хугенхольц П., Ларсен Н., Рохас М., Броди Е.Л. и др. (2006) Greengenes, проверенная химерами база данных генов 16S рРНК и рабочая среда, совместимая с ARB. Appl Environ Microbiol 72: 5069–5072.
        47. 47. Lozupone C, Knight R (2005) UniFrac: новый филогенетический метод сравнения микробных сообществ.Appl Environ Microbiol 71: 8228–8235.

        Узнайте о туберкулезе | Американская ассоциация легких

        Туберкулез (ТБ) — это воздушно-капельная бактериальная инфекция, вызываемая организмом Mycobacterium tuberculosis , который в первую очередь поражает легкие, хотя могут быть поражены другие органы и ткани.

        Ключевые моменты

        • Туберкулез, хотя и заразен, нелегко передается от человека к человеку.
        • Около 1,8 миллиарда человек, или четверть населения мира, инфицированы туберкулезом, но большинство из них болеют латентным туберкулезом.
        • Около 10 миллионов человек во всем мире больны активным туберкулезом.
        • В Соединенных Штатах туберкулез встречается гораздо реже. ТБ почти всегда можно вылечить и вылечить, если принимать лекарства в соответствии с указаниями.

        Как туберкулез влияет на ваш организм

        ТБ вызывается бактерией M. tuberculosis . Он передается от человека к человеку, когда инфицированный человек кашляет или чихает бактерии, распространяя их по воздуху, чтобы их вдохнули другие. Чтобы заразиться туберкулезом, требуется длительное воздействие, поэтому обычно вы заболеете от близкого члена семьи или коллеги по работе, а не от случайного знакомого.После того, как вы вдохнули бактерию, она оседает в легочной ткани.

        Здоровые люди могут заболеть латентным туберкулезом, но болезнь может проявиться только через несколько месяцев или лет, когда иммунная система по какой-то причине станет слабой. Однако люди с ослабленной иммунной системой подвергаются большему риску сразу же заболеть активной формой туберкулеза. Когда они вдыхают бактерию, она оседает в их легких и начинает расти, потому что их иммунная система не может бороться с инфекцией.В этих случаях заболевание туберкулезом может развиться в течение нескольких дней или недель после заражения.

        Когда человек заболевает активным туберкулезом, это означает, что бактерии туберкулеза размножаются и поражают легкие или другие части тела, такие как лимфатические узлы, кости, почки, мозг, позвоночник и даже кожу. Из легких бактерии туберкулеза перемещаются по кровеносной или лимфатической системе в разные части тела.

        Кто подвержен риску заболевания туберкулезом?

        Шансы заразиться туберкулезом наиболее высоки для людей, находящихся в тесном контакте с другими инфицированными.Сюда входят:

        • Семья и друзья инфицированного человека
        • Люди из частей мира с высоким уровнем заболеваемости туберкулезом, включая Индию и части Азии и Африки.
        • Люди в группах с высоким уровнем передачи туберкулеза, включая бездомных, потребителей инъекционных наркотиков и людей, живущих с ВИЧ
        • Люди, которые работают или проживают в учреждениях, в которых размещаются люди с высоким риском, таких как больницы, приюты для бездомных, исправительные учреждения, дома престарелых и дома-интернаты для людей с ВИЧ

        Не у всех, кто инфицирован микробом туберкулеза (латентный туберкулез), развивается клинически активный туберкулез.