Дисбактериоз влагалища и кишечника: Дисбактериоз влагалища: причины, профилактика и лечение

Обсуждения микробиома в здоровье человека обычно сосредоточены на кишечнике.Но как насчет микроорганизмов, которые обитают в других частях тела — например, во влагалище? Влагалищный микробиом — важный, но в значительной степени упускаемый из виду аспект женского здоровья.

Отчасти потому, что ученые знают о микробах пищеварительного тракта гораздо больше, чем о микробах влагалища. Кроме того, существуют культурные факторы, такие как табу на женские гениталии и сексуальность, которые ограничивают открытые, честные разговоры о вагинальных симптомах.

Тем не менее, некоторые из наиболее частых жалоб, которые женщины приносят своим врачам, прямо или косвенно связаны с дисбалансом влагалищной флоры.Многие вагинальные симптомы поддаются лечению с помощью естественных методов лечения, которые восстанавливают баланс микробиома и излечивают симптомы так же эффективно, если не в большей степени, чем обычные антибиотики или противогрибковые препараты.

Дисбактериоз влагалища увеличивает риск инфицирования

Хотя микробиом желудочно-кишечного тракта по-прежнему доминирует в исследовательских кругах, научный интерес к микробиому влагалища растет.

Недавно Университет штата Вирджиния запустил крупную исследовательскую инициативу под названием «Консорциум микробиома влагалища», цель которой — способствовать междисциплинарным исследованиям микрофлоры влагалища и того, как она влияет на здоровье, сексуальность, фертильность женщин, а также здоровье и благополучие младенцев.

Микробиота влагалища состоит в основном из бактерий, дрожжей и грибов. Как и в случае с микробиомом кишечника, экосистема влагалища каждого человека уникальна и зависит от множества факторов: возраста, диеты, окружающей среды, гормонов и генетики. Количество и разнообразие микробов во влагалище «имеют серьезные последствия для общего состояния здоровья женщины», — сказала Лийза Лехторанта, доктор философии, менеджер по исследованиям и разработкам в отделе глобального здравоохранения и диетологии DuPont Nutrition & Biosciences.

Лехторанта, специализирующаяся на исследованиях пробиотических бактерий, объяснила, что у здоровых женщин микробиом влагалища обычно сильно заселен несколькими видами из рода Lactobacillus . «В качестве ключевого признака вагинальные лактобациллы производят молочную кислоту, которая создает кислую микросреду [низкий pH] и предотвращает чрезмерный рост потенциально вредных бактерий», — сказала она.

Но множество факторов окружающей среды и образа жизни могут нарушить этот оптимальный микробный состав. По словам Лехторанты, вагинальный дисбаланс или дисбактериоз является известным фактором риска дрожжевых инфекций и бактериального вагиноза (БВ).

«БВ, в свою очередь, ассоциируется с инфекциями мочевыводящих путей, повышенным риском бесплодия, воспалением маточных труб, неблагоприятными исходами беременности и преждевременными родами».

Дисбактериоз влагалища также коррелирует с инфекциями, передаваемыми половым путем, такими как ВИЧ, вирусы папилломы человека, герпес, хламидиоз и гонорея, добавила она.

Инфекции, вызванные лекарствами

Вульвовагинальные инфекции вызывают миллионы визитов к врачу ежегодно, что является одним из основных состояний, при которых женщины в США обращаются за медицинской помощью. Лечение обычно включает простые изменения образа жизни плюс курс антибиотиков или противогрибковых препаратов.

В случае единичной инфекции стандартная схема лечения антибиотиками обычно облегчает симптомы. Но эти мощные фармацевтические препараты также разрушают тонкий микробиом влагалища, потенциально создавая почву для повторных будущих инфекций, от которых гораздо труднее избавиться.

«Классическая и неудачная трехэтапная последовательность событий часто является отправной точкой для людей с хроническими вагинальными инфекциями», — сказала Эми Дэй, штат Северная Каролина, основательница и медицинский директор Центра здоровья женщин в Беркли, штат Калифорния, Holistic Primary Care. .

Паттерн начинается, когда у пациента развивается инфекция мочевыводящих путей (ИМП), которую лечат антибиотиками.

Сильные антибиотики «сбивают микрофлору влагалища, убивая полезные бактерии вместе с плохими, вызывающими ИМП», — пояснил Дэй. Они могут вывести из строя ИМП, но при этом они создают идеальную среду для беспрепятственного роста грибковых патогенов.

Как и в кишечнике, определенные микробы во влагалище «имеют решающее значение для поддержания баланса хороших бактерий, помогая бороться с вредными бактериями и дрожжами», — сказал Дэй. Появление небольшого количества нежелательных бактерий и дрожжей является нормальным и даже полезным для здоровья при условии наличия достаточного количества полезной флоры, предотвращающей причинение вреда патогенными микробами.

Lactobacilli , например, не дают инфекционным дрожжам, таким как Candida albicans — основной причине генитальных дрожжевых инфекций — достичь опасного уровня. Антибиотики или другие силы, которые разрушают или уничтожают Lactobacilli , создают условия для разрастания Candida .

Восстановление баланса после приема антибиотиков

Очень важно восстановить баланс микрофлоры влагалища после курса антибиотиков. В противном случае сами лекарства, предназначенные для лечения одной инфекции, могут в конечном итоге вызвать другую.

Дэй сказала, что в ее практике «очень часто» можно обнаружить, что пациенты с длительным анамнезом хронической вагинальной инфекции испытывали первые симптомы после лечения антибиотиками.

«Если бы лекарственные препараты всегда работали и не вызывали побочных эффектов, я бы, вероятно, не увидел бы ни одного из этих пациентов, потому что они просто получили бы рецепт со страховкой и покончили с ним.”

«Это работает для некоторых людей», — признала она. «Дифлюкан может вылечить дрожжевую инфекцию, и с пациентом все будет в порядке. Но это сильнодействующий препарат, и он не всегда работает, и часто требует повторного лечения и повторного лечения, если вы не восстанавливаете баланс вагинальной флоры.

Последовательность инфекции ИМП-антибиотик-дрожжевой грибок усугубляется тем, что во многих случаях ее можно предотвратить.

Обучение женщин тому, как поддерживать их собственные здоровые экосистемы влагалища, может минимизировать вероятность повторных инфекций.

«Это определенно неудовлетворенная потребность в области медицины», — предположил Дэй. Пациентам с вагинальными инфекциями часто «выдают рецепт, не выясняя сначала, что на самом деле происходит и что нужно лечить». Другие получают антибиотики или противогрибковые препараты, которые не устраняют их симптомы эффективно, что отправляет их «в Интернет, чтобы попытаться выяснить, что еще они могут сделать для себя». Это очень расстраивает «.

К счастью, «большинство врачей сейчас более осторожно назначают антибиотики без предварительного подтверждения [наличия] ИМП, так что это шаг в правильном направлении», — отметил Дэй.

Микробиом матери и ребенка

Традиционная медицина признает некоторые дополнительные аспекты микробиома влагалища, особенно в контексте беременности и родов.

Возьмите стрептококк группы B (GBS), распространенную бактериальную вагинальную инфекцию с потенциально серьезными последствиями для новорожденных. Врачи регулярно проверяют будущих матерей на наличие СГБ на поздних сроках беременности и проводят необходимое лечение для предотвращения передачи инфекции от матери ребенку.

Но помимо этого, существует также более широкая идея общего «материнского микробиома младенца» (Dunn, AB et al. MCN Am J Matern Child Nurs . 2017; 42 (6): 318-325). Флора кишечника ребенка начинает развиваться в утробе матери , но процесс родов будет значительно влиять на «начальный процесс колонизации микробиома новорожденного».

Во время родов через естественные родовые пути младенцы заражаются микробами из влагалища матери при прохождении через родовые пути.Воздействие здоровой или нездоровой микрофлоры влагалища может повлиять на здоровье ребенка даже спустя долгое время после рождения. Исследования показывают, что у детей, рожденных с помощью кесарева сечения, микробиомы явно отличаются от тех, что родились естественным путем. Младенцы с кесаревым сечением часто несут более высокие уровни условно-патогенных микроорганизмов при рождении по сравнению с младенцами, рожденными естественным путем (Shao, Y et al. Nature .2019; 574: 117–121).

Учитывая, что микрофлора влагалища матери напрямую влияет на микробиом кишечника младенца, некоторые практикующие врачи рекомендуют будущим пациентам принимать добавки с высококачественными пробиотиками в течение последнего триместра.Поддержание здоровой кишечной флоры после рождения особенно важно для детей, рожденных с помощью кесарева сечения.

Гормональные триггеры

Бактерии и дрожжи процветают во влажной и теплой среде, поэтому такие условия, как высокая влажность или мокрая одежда, могут способствовать чрезмерному росту патогенов. Рационы с высоким содержанием рафинированных углеводов являются идеальным источником энергии для сахаролюбивых дрожжей, повышая риск вагинального дисбактериоза.

Колебания гормонов также могут вызывать инфекции. Некоторые пациенты постоянно испытывают ежемесячные обострения хронического БВ или кандидоза в определенные моменты менструального цикла.

Примерно в середине цикла «в процессе овуляции происходит всплеск эстрогена», — отмечает Дэй. Рецидивы во время овуляции не редкость у пациентов, которые часто страдают от дрожжевых инфекций. У других инфекции возникают незадолго до фазы кровотечения, когда уровень гормонов начинает падать. Третьи замечают, что симптомы возвращаются сразу после менструации, поскольку менструальная кровь добавляет влагу и питает вагинальные микроорганизмы.

Низкий уровень эстрогена в более старшем возрасте также может быть проблемой.«В постменопаузальный период у некоторых людей наблюдается учащение ИМП и вагинальных инфекций», — сказал Дэй. Снижение эстрогена в слизистой оболочке влагалища соответствует более слабой иммунной реактивности, вероятно, в результате снижения кровообращения. Лечение местной эстрогеновой терапией может помочь повысить иммунитет и предотвратить дополнительные инфекции.

Медицинские красные флаги

Некоторые женщины осознают, что их симптомы проявляются в определенное время или при определенных условиях, а другие — нет.

Вы можете помочь, попросив пациентов внимательно отслеживать и задокументировать случаи заражения. При оценке обострений пациентки обязательно спрашивайте о ее диетических привычках, выборе одежды, времени менструации и условиях окружающей среды. Происходят ли инфекции предсказуемо на определенном этапе менструального цикла, или после определенных отпусков или определенных типов приема пищи?

Потратив время на то, чтобы задать эти вопросы, можно получить жизненно важную информацию о микробиоме влагалища пациентки.

В тех случаях, когда триггеры инфекции не обнаруживаются сразу, копайте глубже. Хронические инфекции половых путей — или где-либо еще, если на то пошло — являются медицинскими тревожными флажками для основных проблем.

«Разрастание дрожжей во влагалище может происходить само по себе, но я думаю о дрожжах в кишечнике в тех случаях, когда вагинальная дрожжевая инфекция повторяется», — отметил Дэй. «Кишечник может действовать как резервуар, и даже после лечения вагинальной дрожжевой инфекции любые оставшиеся дрожжи могут перемещаться из заднего прохода во влагалище и вызывать другую инфекцию.”

По этой причине доктор Дэй говорит, что она часто сочетает местное вагинальное лечение с системными пероральными противомикробными препаратами.

Хронические вагинальные инфекции также могут указывать на ослабленную иммунную систему. Всегда «проверяйте наличие любых признаков повторяющихся инфекций, которые могут указывать на состояние иммунодефицита».

Тщательно проверить

При лечении вагинальных симптомов постарайтесь определить точную причину бактериальной или дрожжевой инфекции и проведите соответствующее лечение. Это повысит вероятность успешного искоренения, а также снизит риск рецидива.

Необычные выделения из влагалища, характеризующиеся изменением цвета, консистенции или запаха, а также покраснение, отек, сыпь, зуд или раздражение влагалища или вульвы, являются типичными индикаторами дисбактериоза влагалища. Но «симптомы зависят от рассматриваемой инфекции», — предупреждает доктор Лехторанта.

В настоящее время доступен ряд различных вариантов тестирования, в том числе домашние наборы для тестирования, чтобы охарактеризовать микробиом влагалища и определить, какой тип инфекции может присутствовать.Одним из примеров является Профиль вагиноза по данным врача, который пациенты могут заполнить дома и отправить в лабораторию для анализа.

Тестирование — «фантастический способ получить больше информации, особенно для женщин, которые борются с хроническими и повторяющимися инфекциями», — говорит Дэй. Для получения результатов может потребоваться несколько дней, поэтому тестирование в острых случаях, требующих немедленного лечения, несколько менее полезно. Но в целом «очень полезно знать об уровнях [у пациента] хороших и плохих бактерий и дрожжей … чтобы помочь в принятии решений о лечении.”

Естественные альтернативы

Множество естественных методов лечения могут эффективно лечить многие симптомы дисбактериоза влагалища, не вызывая вредных побочных эффектов.

Начните с поощрения пациентов пить больше воды.

Добавки, такие как d-манноза, витамин C, пробиотики или травы, такие как uva ursi и берберин, являются отличным вариантом для пациентов с ИМП.

При подтвержденных дрожжевых инфекциях в качестве лечения Дэй можно использовать борную кислоту или дрожжевой арест, натуральные вагинальные суппозитории от Dr.Линия пищевых добавок Vitanica от Тори Хадсон. Продукт представляет собой гомеопатический суппозиторий на основе масла какао и поддерживающих натуральных ингредиентов, включая борную кислоту, масло чайного дерева, масло нима, корень винограда Орегон, пробиотики Lactobacillus и гомеопатические растительные компоненты на основе масла какао. «Он очень эффективен при облегчении неприятных симптомов и обычно полностью избавляет от инфекции при использовании дважды в день в течение 7-14 дней», — сообщила она.

Ботанические противогрибковые добавки, такие как CandidaStat (Vitanica) или Biocidin (Biobotanical Research), могут принести дополнительную пользу пациентам, обеспечивая дополнительную системную поддержку во время лечения инфекции.

«Если инфекция настолько серьезна, что антибиотики действительно необходимы, тогда пациенту всегда следует давать пробиотики вместе с этим рецептом», — убеждал Дэй. Использование «высоких доз пробиотических добавок во время курса антибиотиков — принимаемых в другое время дня, за два часа до приема антибиотиков — и затем в течение двух-четырех недель после этого — может помочь сохранить здоровую флору и предотвратить вагинальные инфекции». дрожжевая инфекция ».

Она добавила, что вагинальные пробиотики имеют смысл, «независимо от того, какое лечение используется для уничтожения инфекции.”

Добавление пероральных пробиотиков также может помочь поддерживать или повышать здоровый уровень вагинальных лактобацилл . DuPont’s HOWARU® Feminine Health сочетает в себе Lactobacillus rhamnosus HN001 ™ и L actobacillus acidophilus La-14 ®, два штамма бактерий, предлагающих «благоприятные эффекты в отношении лечения BV и вульвовагинального кандидоза в качестве дополнения к антибиотической или противогрибковой терапии, соответственно» — сказала Лехторанта.

«В отличие от антибиотиков и противогрибковых препаратов, предназначенных для уничтожения вредных бактерий и дрожжей, которые могут быть вредными для внутренней микробиоты влагалища, пробиотические штаммы в HOWARU® Feminine Health предназначены для поддержания хорошего баланса лактобацилл во влагалищном тракте», — она сказал. Пробиотики в HOWARU® способствуют выработке молочной кислоты и перекиси водорода, что снижает уровень pH во влагалищной среде.

Jarrow Formulas ‘Fem-Dophilus — еще один широко используемый пробиотик для здоровья влагалища, который можно глотать перорально или вводить вагинально один раз в день перед сном, чтобы помочь восстановить полезную флору и предотвратить рецидив инфекции.

Ось кишечника и влагалища

Точно так же, как диета влияет на микробиом кишечника, она также влияет на разнообразие микробов во влагалище.

Уменьшение количества или исключение углеводов, сахара и алкоголя часто облегчает вагинальные симптомы и предотвращает их повторение. Пациентам со стойкими дрожжевыми инфекциями может потребоваться строгая антикандидозная диета с нулевым содержанием сахара или с низким содержанием плесени. Люди с менее тяжелыми или менее частыми инфекциями могут переносить умеренное количество сахара или других углеводов.

«Имеются значения, что западная диета и высокое содержание насыщенных жиров могут вызвать системное воспаление, которое может иметь неблагоприятное влияние на состав микробиоты влагалища через так называемую« ось кишечник-влагалище »», — предупредил Лехторанта.

Не менее важно, что из рациона удаляется то, что в нем остается. В дополнение к большому количеству свежих или слегка приготовленных овощей, женщинам целесообразно увеличить потребление ферментированных овощей, йогурта или других продуктов, содержащих Lactobacillus .

Пациенты с риском вагинальных инфекций могут еще больше снизить вероятность рецидива, если надеть нижнее белье из хлопка или другой дышащей ткани и сразу же после использования сменить облегающие купальные костюмы или потную одежду для тренировок.

Также рекомендуется избегать спринцевания и вместо этого промывать вульвовагинальную область только водой.

КОНЕЦ

Что значит здоровье кишечника для здоровья влагалища

Заботы о хорошем здоровье кишечника и о том, как его поддерживать, в наши дни, кажется, повсюду, и, нет, не только из-за стремительного роста популярности чайного гриба.

Интерес к здоровью кишечника имеет веские причины: как говорит гастроэнтеролог из Феникса доктор Лиз Круз просто: «Ваше здоровье начинается с кишечника. Это влияет на каждую часть вас ». Это может включать и влагалище.

Так как же сохранить здоровый кишечник и, в свою очередь, здоровое влагалище? Мы поговорили со специалистами.

Что означает плохое здоровье кишечника

В вашем кишечнике миллионы бактерий, объясняет Круз, и если вредные бактерии в кишечнике влияют на баланс кишечных бактерий в кишечнике, именно здесь могут возникнуть проблемы.

Плохие бактерии в кишечнике могут появиться из-за неправильного питания (включая продукты с высоким содержанием сахара), стресса, малоподвижного образа жизни и даже некоторых лекарств. Круз объясняет, что когда ваше тело пытается построить здоровые клетки, но не может этого сделать из-за обилия вредных бактерий, это негативно влияет на ваши клетки, ткани и органы.

Некоторые из последствий плохого здоровья кишечника, по словам Круза, могут включать боль в животе, рвоту, тошноту, диарею, летаргию, вздутие живота, изжогу и изменение веса, среди других симптомов.

Влияет ли здоровье кишечника на здоровье влагалища?

«Подобно кишечнику, влагалище содержит миллионы, миллиарды или даже триллионы микробов, составляющих его нормальную флору», — говорит доктор Сара Твогуд, доцент кафедры клинического акушерства и гинекологии Университета Южной Калифорнии.

Однако она объясняет, что, хотя кишечные бактерии и вагинальные бактерии содержат некоторые микробы, которые могут частично совпадать, «вся флора будет другой».

Тем не менее, это не означает, что плохое состояние кишечника не может вызывать проблем с влагалищем.Круз говорит, что распространенная проблема, с которой она сталкивается с женщинами, которые сталкиваются с осложнениями, связанными с плохим здоровьем кишечника (т. Е. «Когда вредные бактерии разрастаются над хорошими бактериями»), — это дрожжевые инфекции.

Еще одна серьезная проблема со здоровьем, которая может возникнуть в результате проблем с кишечником, — это инфекция мочевыводящих путей. Круз объясняет, что, поскольку кишечник «не является стерильной средой» и если уретра подвергается воздействию определенных бактерий, «они могут подняться в мочевой пузырь и вызвать ИМП».

Это может стать особенно неприятным для тех, кто страдает диареей и / или не соблюдает надлежащую гигиену.«Это одна из причин, почему протирание спереди назад важно, — говорит Твогуд, — чтобы свести к минимуму воздействие стула на уретру».

Если вы испытываете жжение, боль и дискомфорт во влагалище, Твогуд просит вас осмотреть и осмотреть гинеколог. «Многие женщины неправильно диагностируют свои вульвовагинальные проблемы, и это приводит к тому, что методы лечения не работают и могут еще больше вызвать раздражение».

Как поддерживать хорошее здоровье кишечника и хорошее здоровье влагалища

В дополнение к соблюдению правил гигиены, Круз говорит, что лучшее, что вы можете сделать, — это принимать пробиотики, особенно те, которые содержат количества в миллионах и миллиардах живых культур и имеют несколько штаммов.«Это помещает полезные бактерии в ваш кишечник и, в свою очередь, помогает вашей иммунной системе», — говорит она.

То, что вы едите, может сильно повлиять на здоровье кишечника, и здесь действительно могут помочь ферментированные продукты и напитки, такие как соленые огурцы, квашеная капуста, кимчи, мисо и вышеупомянутый чайный гриб.

Йогурт — это пища, которая помогает поддерживать здоровье кишечника и влагалища, поскольку «считается, что йогурт помогает поддерживать здоровье влагалища из-за содержащихся в нем пробиотиков», — говорит Твогуд. Однако, если у вас есть проблемы с молочными продуктами или сахаром, Круз советует внимательно читать этикетки при выборе лучшего йогурта.

Круз объясняет, что пробиотики, а также продукты и напитки, богатые пробиотиками, могут дать вашему организму питательные вещества, необходимые для создания здоровых клеток. Если у вас проблемы с кишечником, ваше тело начало исчерпывать запасы полезных питательных веществ, и именно тогда могут начать проявляться симптомы.

Если вы считаете, что у вас проблемы с кишечником, ведущие к проблемам со здоровьем, лучше всего посетить гастроэнтеролога, который сможет оценить ваше здоровье, а также провести все тесты, необходимые для выяснения причины.Хотя это может показаться ужасным местом, Круз уверяет, что при правильном лечении и уходе «надежда есть».

пробиотиков и бактериального вагиноза | Лаборатория по изучению пробиотиков

Бактериальный вагиноз (БВ) — наиболее частая инфекция у женщин детородного возраста, поражающая примерно 1 из 3 женщин. Тем не менее, что удивительно, многие женщины даже не слышали об этом. В этой статье мы рассмотрим, что такое BV, как пробиотики от BV могут помочь тем, кто страдает этим заболеванием, и обсудим, какие штаммы пробиотиков являются лучшими для здоровья влагалища.

Что такое бактериальный вагиноз?

Бактериальный вагиноз (БВ) — это заболевание влагалища, при котором появляются серые водянистые выделения с неприятным запахом. Это вызвано чрезмерным ростом вредных бактерий, известных как патогены.

Микробиом кишечника состоит из смеси «дружественных» пробиотических бактерий и небольшого количества «вредных» патогенных бактерий, так же как и микробиом влагалища. Когда количество патогенов превышает количество хороших бактерий в любом микробиоме, это называется дисбактериозом, который может привести к инфекции.Возможно, вы захотите узнать больше о дисбактериозе кишечника и о том, как с ним бороться, в статье, что такое дисбактериоз?

Если вам поставили диагноз BV, вполне вероятно, что ваш врач назначит антибиотики для лечения инфекции. Это может принести временное облегчение; однако со временем антибиотики действительно могут усугубить дисбактериоз. Прочтите нашу статью о приеме пробиотиков с антибиотиками.

BV обычно вызывается чрезмерным ростом Gardnerella vaginalis, , хотя Prevotella, Mycoplasma hominis, и Mobiluncus также могут быть замешаны в инфекциях BV.В здоровом влагалище содержится множество бактерий из рода Lactobacillus. Прочтите эту статью, чтобы узнать больше о Lactobacillus.

Лактобациллы помогают поддерживать здоровую среду влагалища, ферментируя гликоген из стенок влагалища с образованием молочной кислоты. Молочная кислота снижает pH влагалища, поддерживая его на здоровом уровне ниже 4,5, что важно для интимного здоровья. Если влагалище станет слишком щелочным, будут процветать болезнетворные бактерии. Это становится порочным кругом, поскольку чрезмерный рост патогенов повышает pH, что, в свою очередь, стимулирует размножение вредных бактерий.

Женщины часто не подозревают о том, что у них есть БВ, поскольку в 50% случаев он не вызывает симптомов. Однако, если его не лечить, это может привести к другим осложнениям, таким как снижение фертильности , повышение риска выкидыша и снижение веса при рождении, когда беременность все же наступит.

Что вызывает BV?

Как уже объяснялось, БВ — это дисбаланс тонкой флоры, обитающей во влагалище. Это не считается инфекцией, передающейся половым путем.

Микробиом влагалища может стать несбалансированным по разным причинам:

• Сексуальная активность — хотя БВ не является инфекцией, передающейся половым путем, незащищенный секс может повысить вероятность инфицирования БВ.Это связано с тем, что каждый половой партнер может заносить новые бактерии во влагалище, нарушая хрупкое равновесие. Исследование 2020 года ⁵ показало, что оральный секс также может нарушить микробиом влагалища. Специфический патоген, Fusobacterium nucleatum, , обычно обнаруживаемый во рту и связанный с заболеванием десен, также связан с BV. Было обнаружено, что он способствует росту наиболее распространенного возбудителя BV, Gardnerella vaginalis . Исследование предполагает, что наиболее вероятное объяснение того, что этот патоген может быть обнаружен во влагалищном тракте, связан с оральным сексом.
• Если вы используете внутриматочную спираль (ВМС)
• Курение
• Использование душистого мыла, антисептических жидкостей для ванн, пены для ванн или вагинального дезодоранта — это может слишком сильно подщелачивать влагалище, что приводит к размножению нежелательных штаммов бактерий и возникновению инфекции.
• Спринцевание или промывание влагалища водой или другими жидкостями — это также может изменить pH влагалища и стимулировать рост патогенных бактерий
• Использование сильнодействующих моющих средств при стирке нижнего белья

Однако для подавляющего большинства больных не существует очевидной внешней причины дисбактериоза.В этих случаях необходимо учитывать связь между флорой кишечника и флорой влагалища.

Поскольку влагалище расположено близко к анальному отверстию, бактерии могут легко перемещаться из одной области в другую. Таким образом, любые патогенные штаммы бактерий, присутствующие в кишечнике, могут попасть во влагалище через задний проход и вызвать дисбаланс хрупкого баланса флоры там.

Чтобы узнать больше о том, как поддерживать баланс вагинального микробиома, прочтите Все о вашей влагалищной флоре.

Какие пробиотики лучше всего подходят для лечения БВ?

Учитывая, что BV представляет собой дисбаланс бактерий во влагалище, было бы логично, что повышение уровня «дружественных» бактерий с помощью пробиотических добавок может быть полезным. Но какие пробиотики БВ являются лучшими?

Ученые хорошо знают, что разные пробиотики действуют по-разному. Штаммы, помогающие при БВ, должны быть в состоянии выжить при прохождении через весь пищеварительный тракт, а затем мигрировать во влагалище и колонизировать его.

В настоящее время проводятся обширные исследования эффективности вагинальных пробиотиков. Понятно, что род Lactobacillus является преобладающим родом бактерий, обнаруживаемых в здоровом влагалище. Итак, большинство исследований пробиотиков для вагинального здоровья сосредоточено вокруг видов Lactobacillus. В этом разделе мы рассмотрим следующие штаммы Lactobacillus, которые были исследованы на предмет поддержки BV:

В рандомизированном двойном слепом плацебо-контролируемом исследовании ¹ 125 женщин с БВ были разделены на две группы.Одна группа получала 7-дневный курс антибиотиков, а вторая группа получала оба антибиотика в сочетании с пробиотическим составом, содержащим пробиотические штаммы L. rhamnosus GR-1 ^® и L. reuteri RC-14 ^® . Эти два штамма дружественных бактерий были первоначально выделены из здорового влагалищного тракта, что свидетельствует о том, что они являются неотъемлемой частью микробиоты влагалища.

Прием пробиотиков продолжали еще в течение 3 недель после окончания антибактериальной терапии.Показатели успеха увеличились с 40% (при использовании только антибактериальной терапии) до 88% (при комбинированной терапии)!

Не только L. rhamnosus GR-1 ^® и L. reuteri RC-14 ^® достигают интимной области и прилипают к слизистой оболочке влагалища, они также эффективно колонизируют эту область. Их присутствие в вагинальных мазках, взятых в течение 3 недель после прекращения приема пробиотиков, является демонстрацией этого.

Добавка Optibac Probiotics для женщин содержит л.rhamnosus GR-1 ^® и L. reuteri RC-14 ^® .

Медицинские работники могут узнать больше об исследовании с использованием L. rhamnosus GR-1® и L. reuteri RC-14® в базе данных пробиотиков.

Ключ на вынос

• Lactobacillus rhamnosus GR-1® и Lactobacillus reuteri RC-14® являются естественными резидентами здорового микробиома влагалища и были тщательно исследованы на предмет поддержки БВ и здоровья влагалища.

Клиническое испытание 2006 года продемонстрировало, что пробиотический штамм Lactobacillus paracasei F-19 ^® был способен улучшить вагинальный pH и запах у пациентов с вагинозом ⁵ . Женщины, которым перорально вводили пробиотик Lactobacillus paracasei F-19 ^® , в дополнение к вагинальным суппозиториям, содержащим Lactobacillus acidofilus , сохраняли облегчение даже через 3 месяца после окончания лечения.

Этот штамм также можно найти в Optibac Probiotics для женщин

Другое крупное клиническое испытание показывает дальнейшие перспективы использования пробиотических штаммов у больных БВ. Практикующие медицинские работники могут узнать больше об этом клиническом испытании на странице Probiotic Professionals .

Ключ на вынос

• Было показано, что пробиотический штамм Lactobacillus paracasei F-19® улучшает pH влагалища и запах у женщин с BV

В довольно небольшом, но хорошо спланированном двойном слепом рандомизированном контролируемом исследовании ² 34 женщины с БВ получали либо вагинальную таблетку пробиотика, либо плацебо в течение 7 дней.Пробиотик содержал не менее 10 миллиардов жизнеспособных лактобацилл; в частности, L. brevis CD2 ^® , L. salivarius FV2 ^® и L. plantarum FV9 ^® . Частота купирования симптомов за 2 недели составила 61% (11 из 18) в группе активного лечения. По сравнению с 19% (три из 16) в группе плацебо (p = 0,017) — это поразительные результаты!

Ключ на вынос

• Было продемонстрировано, что симптомы BV облегчаются пробиотическими штаммами Lactobacillus brevis CD2®, Lactobacillus salivarius FV2® и Lactobacillus plantarum FV9®

В двойном слепом плацебо-контролируемом рандомизированном исследовании ³ изучались штаммы пробиотиков L.acidophilus La-14 ^® и L. rhamnosus HN001, наряду с бычьим лактоферрином. Было показано, что при добавлении к лечению антибиотиками эта комбинация значительно улучшает симптомы BV. Кроме того, это также снизило частоту рецидивов по сравнению с лечением только антибиотиками.

48 взрослых женщин с симптомами БВ получали либо антибиотики, либо смесь пробиотиков для перорального приема, а также лактоферрин в течение семи дней; или антибиотики плюс плацебо. После этого группы были проинструктированы принимать по одной капсуле в день в течение десяти дней каждый месяц (начиная с первого дня менструации) либо пробиотиков плюс лактоферрин, либо плацебо в течение шести месяцев.

Симптомы, такие как выделения из влагалища и зуд, были заметно уменьшены при применении комбинированной пробиотической терапии по сравнению с плацебо. Что наиболее важно, частота рецидивов также была намного ниже. Медицинские работники могут посетить базу данных пробиотиков, чтобы узнать больше об исследованиях с участием L. rhamnosus HN001

Ключ на вынос

• Lactobacillus acidophilus LA14® и Lactobacillus rhamnosus HN001 было показано, что пробиотические штаммы значительно улучшают симптомы БВ при приеме в сочетании с лечением антибиотиками

Lactobacillus crispatus CTV-05 недавно был оценен в двойном слепом рандомизированном плацебо-контролируемом исследовании на предмет его эффектов у 228 женщин в пременопаузе с рецидивирующим бактериальным вагинозом.В группе вмешательства женщинам вводили 2 миллиарда КОЕ L. crispatus CTV-05 с помощью вагинального аппликатора ежедневно в течение 24 недель по сравнению с плацебо. К 12 неделе 30% группы вмешательства имели рецидив бактериального вагиноза по сравнению с 45% группы плацебо (p = 0,01). Эти положительные результаты сохранялись до 24 недели ⁴ .

Ключ на вынос

• Исследование 2020 г. показало, что рецидивы BV были ниже у женщин в пременопаузе, принимавших Lactobacillus crispatus CTV-05

Как следует принимать пробиотики при БВ?

Вы можете задаться вопросом, как действуют вагинальные пробиотики и лучше ли вводить пробиотики для влагалища перорально или вводить интравагинально.

Ответ: оба метода показывают одинаковую эффективность, поэтому это зависит от индивидуальных предпочтений. Большинство женщин предпочитают легкость и удобство пероральной капсулы. Исследования показали, что до тех пор, пока правильный штамм бактерий принимается перорально (то есть те, которые любят колонизировать влагалищный тракт), бактерии легко могут выжить при прохождении через кишечник. Затем они могут совершить путешествие из прямой кишки во влагалище. Это было доказано клиническими испытаниями, согласно которым определенные пробиотики были обнаружены во влагалищных мазках вскоре после их приема внутрь.

Рекомендации по длительной профилактике БВ

Вопрос, который часто задают пациенты, страдающие БВ, звучит так: «Как предотвратить повторение БВ?».

К настоящему времени мы узнали, что БВ — это дисбаланс в микробиоме влагалища, и следующие меры могут помочь сохранить баланс вагинальных бактерий и снизить риск повторных инфекций БВ:

• Соблюдение диеты с низким содержанием сахара может быть полезным для снижения вероятности выделения глюкозы с мочой, что может способствовать чрезмерному росту вредных бактерий во влагалище.
• Снижение стресса полезно для здоровья влагалища и общего состояния. Исследование ⁷ 2018 года обнаружило связь между высоким уровнем гормона стресса кортизола и БВ. Очень важно найти время для отдыха!
• Использование мягких средств для ванн и моющих средств без запаха является хорошей идеей, поскольку они не нарушают нормальный pH-баланс влагалища.
• Не спринцевывайте и не промывайте влагалище водой. В этом нет необходимости, потому что влагалище создано таким образом, чтобы оно оставалось чистым
• Использование защиты во время секса может помочь поддерживать хороший баланс бактерий во влагалище, что снижает вероятность заражения BV
• Рассмотрите возможность использования орального вагинального пробиотика, содержащего тщательно изученные пробиотические штаммы, такие как L.rhamnosus GR-1 ^® и L. rhamnosus HN001, которые, как было показано, помогают поддерживать BV
• Подумайте о поддержке здоровья кишечника, а также здоровья влагалища. Прочтите нашу статью: Здоровье кишечника: все, что вам нужно знать

Если вы хотите узнать больше о женском интимном здоровье, вы можете прочитать больше здесь:

Все о флоре влагалища

Какие пробиотики лучше всего подходят для женщин?

Практикующие врачи могут обратиться к специалистам по пробиотикам, чтобы узнать больше о роду Lactobacillus и его штаммах в базе данных пробиотиков.

Список литературы

1. Anukam, et al. (2006). Увеличение противомикробной терапии бактериального вагиноза пероральными пробиотиками Lactobacillus rhamnosus GR-1 и Lactobacillus reuteri RC-14. Microbes Infect, 8 (6): pp. 1450-4
.
2. Mastromarino et al. (2009). Эффективность вагинальных таблеток, содержащих Lactobacillus, при лечении симптоматического бактериального вагиноза. Clin Microbiol Infect, 15 (1): стр. 67-74
3. Russo R et al. (2018). Доказательная смесь, содержащая штаммы Lactobacillus и лактоферрин для предотвращения рецидивов бактериального вагиноза: двойное слепое плацебо-контролируемое рандомизированное клиническое исследование.Полезные микробы, опубликовано в Интернете перед печатью 10 декабря 2018 г.
4. Cohen, C. et al. (2020) «Рандомизированное испытание лактина-V для предотвращения рецидива бактериального вагиноза», Медицинский журнал Новой Англии, стр. 382 (20), 1906-1915 гг.
5. Delia A, et al., 2006
6. Agarwal K. 2020. Перекрестное вскармливание гликанов поддерживает мутуализм между Fusobacterium и микробиотой влагалища. PLOS Биология. https://journals.plos.org/plosbiology/article?id=10.1371/journal.pbio.3000788
7. Amabebe E, Anuma D (2018) Психосоциальный стресс, уровни кортизола и поддержание здоровья влагалища.Границы эндокринологии, 9: 568

Статья обновлена: 30 сен 2021 г. Первоначально опубликовано: 22 февраля 2021 г.

Отчетливый профиль микробиоты кишечника и влагалища у женщин с рецидивирующей неудачей имплантации и необъяснимым бесплодием

1. Введение

Бесплодие, определяемое как неспособность зачать ребенка после 1 года незащищенного полового акта в надлежащее время, является болезненным и дорогостоящим репродуктивным расстройством, которое влияет на до 15% пар во всем мире (Kamel 2010).Некоторые известные причины бесплодия включают заболевания органов малого таза, перитонеальные факторы, факторы шейки матки, нарушения овуляции, репродуктивное старение женщин и мужские факторы (Lindsay and Vitrikas 2015).

Несмотря на это знание, некоторым парам ставится диагноз необъяснимого бесплодия (UE), потому что лежащие в основе механизмы остаются неопределенными даже после оценки овуляторной функции, проходимости маточных труб и параметров спермы (Bellver, Soares et al. 2008). К сожалению, многие бесплодные пары проходят несколько неудачных циклов вспомогательной репродуктивной технологии (ВРТ) (т.е., ЭКО и / или интрацитоплазматическая инъекция сперматозоидов (ИКСИ)) и, таким образом, диагностируются как имеющие повторную неудачную имплантацию (RIF) (Bellver, Soares et al. 2008, Simon and Laufer 2012, Polanski, Baumgarten et al. 2014). Существует еще одна подгруппа бесплодных пар, у которых диагностирована повторяющаяся потеря беременности (RPL), которые зачатие несколько раз (≥3), но выкидыш происходит каждый раз до 28 недели гестации, хотя по поводу ее определения существуют разногласия (Christiansen, Nielsen et al. 2006). , El Hachem, Crepaux et al.2017). Утверждалось, что RIF и RPL представляют один и тот же спектр состояний (Christiansen, Nielsen et al. 2006).

Патологии всех этих загадочных состояний сходятся в механизмах, с помощью которых эмбрион не может имплантироваться в матку, что также называется неудачей имплантации (Graham, Seif et al. 1990, Christiansen, Nielsen et al. 2006, Bellver, Soares et al. 2008). , Саймон и Лауфер 2012). Это основной лимитирующий фактор для естественных и беременностей in vitro с помощью оплодотворения (ЭКО) (Bellver, Soares et al.2008 г., Эрнандес-Варгас, Муньос и др. 2020). Неудачная имплантация включает триумвират эмбриона низкого качества, невосприимчивого эндометрия и несвоевременного взаимодействия эмбриона и эндометрия, из которых невосприимчивый эндометрий является наиболее важным фактором. (Саймон и Лауфер 2012). Фактически, невосприимчивый эндометрий является причиной двух третей всех неудач (Simon and Laufer 2012). Хотя было выявлено множество факторов, нарушающих восприимчивость эндометрия, включая стероидный гормональный дисбаланс, тромботические нарушения, гипергомоцистеинемию и иммунные дисфункции, многое остается неясным (Bellver, Soares et al.2008 г., Саймон и Лауфер 2012 г., Чо, Ким и др. 2019).

Бактерии репродуктивного тракта влияют на неудачу имплантации эндометриального происхождения (Аль-Насири, Амброзино и др., 2020). Например, у женщин с микробиотой, не преобладающей среди Lactobacillus , в рецептивном эндометрии частота имплантации была ниже, чем у женщин с преобладанием Lactobacillus (> 90%) микробиоты (Moreno, Codoñer et al., 2016). Виды хламидий в эндоцервиксе женщин, перенесших ЭКО-ЭТ, коррелировали с неудачей имплантации (Witkin, Sultan et al.1994).

Все чаще исследователи изучают, как местная микробиота влияет на физиологию в дистальных участках, особенно как кишечные бактерии, самые плотные и самые разнообразные бактериальные сообщества тела, воздействуют на дистальные органы, включая мозг и легкие, что приводит к представлению о кишечнике. ось головного мозга и ось кишечника – легочной микробиоты (Ravel and Brotman, 2016, Budden, Gellatly et al., 2017). Однако до сих пор роль кишечных бактерий в неудачной имплантации эндометриального происхождения остается неизученной, не говоря уже об оси микробиоты кишечника и репродуктивного тракта, хотя существует убедительное обоснование.Действительно, кишечные бактерии влияют на иммунную систему, гормональный гомеостаз и систему свертывания крови — все это способствует успеху имплантации (Alexander, Targan et al., 2014, Baker, Al-Nakkash et al., 2017, Vinchi, 2019). Коморбидность кишечных расстройств (например, глютеновой болезни) с расстройствами бесплодия, включая повторяющуюся потерю беременности, указывает на роль «оси кишечник-репродуктивный тракт» в неудаче имплантации (Tersigni, D’Ippolito et al. 2018).

Таким образом, мы исследовали, возникает ли дисбактериоз кишечника у женщин с неудачной имплантацией, и если да, то сопровождает ли он дисбактериоз влагалища, который обычно включает снижение уровней Lactobacillus или защитных видов Lactobacillus и одновременное повышение уровня разнообразие и плотность других бактерий (Madhivanan, Alleyn et al.2015 г., Амабебе и Анумба, 2018 г., Ван, Фан и др. 2020). С этой целью, используя секвенирование гена 16S рРНК, мы сравнили разнообразие, структуру и таксономический состав фекальной и вагинальной микробиоты фертильных женщин с микробиотой бесплодных женщин с историей RIF и UE.

2. Материалы и методы

2.1 Участники исследования

Для этого ретроспективного одноцентрового когортного исследования были отобраны фертильные и бесплодные женщины, направленные в больницу и научно-исследовательский институт Аканкши в период с сентября 2018 года по февраль 2019 года и разделенные на три группы. : группы управления, РИФ и УП.Критериями включения в группу RIF были женщины, которые не могли забеременеть после ≥2 циклов переноса свежих эмбрионов ЭКО / ИКСИ или имели ≥3 выкидышей подряд. UE был диагностирован, если причина остается неустановленной после наших обычных тестов на фертильность со следующими критериями: бесплодие более 1 года, нормальный партнер-мужчина, нормальный менструальный ритм с регулярной овуляцией и нормальные гормональные тесты (например, щитовидная железа, пролактин, AMH) Исключение Критерии включали диабет, синдром поликистозных яичников и эндометриоз, диарею, продолжающуюся беременность, зависимость (например,g., наркотики, алкоголь, табак и т. д.), а также использование антибиотиков в течение как минимум двух недель до взятия образца. Мы выполнили все отборы проб и эксперименты с одобрения местного этического комитета Sat Kaival Hospital Pvt. Ltd (EC2013 / 053). Участники дали свое устное и письменное информированное согласие на сбор образцов фекалий и влагалища и последующий микробиологический анализ. Мы записали и сравнили характеристики участников (Таблица 1) .

Исследуйте характеристики контрольной, РИФ и групп UE.Данные выражены в виде среднего значения ± стандартное отклонение или n / N (%) RIF, рецидивирующая неудача имплантации; UE — бесплодие необъяснимого характера; ИМТ, индекс массы тела; Вегетарианский, вегетарианский; NA, не применимо. Различия между 3 группами оценивали с помощью однофакторного дисперсионного анализа, а для апостериорных сравнений использовали критерий множественного сравнения Тьюки, если Р <0,05. В группе РИФ двое участников относились к категории РПЛ. а. статистически значимая разница между КОН и РИФ.

2.2 Сбор образцов

Образцы фекалий и влагалища были недавно собраны одновременно.Участники собрали образцы фекалий в стерильный пластиковый контейнер с плотно закрывающейся крышкой. Чтобы собрать образцы из влагалища, используя стерильную палочку для тампона, врачи тщательно протерли задний свод влагалища участников. Эти мазки хранили в стерильных флаконах. Оба типа образцов были упакованы и сначала помещены в замороженное хранилище при -20 ° C в больнице, а затем, в течение 24 часов, транспортированы на льду для хранения при -80 ° C в Биотехнологическом исследовательском центре Гуджарата (GBRC) для дальнейшего анализа. .

2.3 Экстракция ДНК

Экстракцию ДНК проводили из примерно 200 мг образцов фекалий и ~ 1 мл тщательно перемешанного образца тампона с использованием QIAamp DNA Stool Mini Kit в соответствии с инструкциями производителя. Тотальную ДНК элюировали 30 мкл буфера AE. Концентрацию ДНК определяли количественно флуорометрически с помощью набора Qubit 2.0 dsDNA HS Assay kit. ДНК хранили при -20 ⁰ ° C для дальнейших процедур.

2.4 Подготовка библиотеки и секвенирование 16s рРНК

Гипервариабельные области V2-V3 гена 16S рРНК амплифицировали с использованием гибридных праймеров 101 □ F5’ACTGGCGGACGGGTGAGTAA 3 ‘и 518 □ R 5’CGTATTACCGCG’CTG.Библиотеки ампликонов очищали с использованием Agencourt AMPure XP (Beckman Coulter). Для контроля качества мы использовали Биоанализатор с набором для анализа ДНК-HS. Все библиотеки были количественно определены с использованием флуориметра Qubit v4.0 и были объединены в эквимолярные концентрации. Секвенирование с клональной амплификацией (эмульсионная ПЦР) выполняли в системе Ion S5 с использованием набора Ion 520/530 OT2 (ThermoFisher Scientific) с системой Ion One Touch 2, в которой используется чип 530 на секвенсоре Ion S5 plus в соответствии с инструкциями производителя.

2.5 Биоинформатика и статистический анализ

Разнообразие

Богатство и разнообразие микробного сообщества оценивали с помощью α-разнообразия, которое включало индексы Chao1 и Шеннона. Тест Краскела – Уоллиса использовался для определения статистических различий между тремя группами. U-критерий Манна-Уитни использовался для определения влияния диеты на α-разнообразие. β-разнообразие, различия в структурах микробных сообществ между тремя группами, было проанализировано с помощью Принципно-координатного анализа (PCoA) на основе расстояний Брея-Кертиса и Жаккара, а статистическая разница между группами была рассчитана с использованием непараметрического многомерного дисперсионного анализа ( ПЕРМАНОВА).

Программное обеспечение QIIME2 использовалось для расчета индексов альфа- и бета-разнообразия. Демультиплексированные последовательности были загружены в среду QIIME2, и шумоподавление было выполнено с использованием DADA2. Варианты последовательности ампликона (ASV) были предсказаны при минимальной глубине выборки 25000 для наборов данных Gut и 9000 для наборов данных влагалища. Предсказанные ASV были таксономически классифицированы с использованием предварительно обученного классификатора полной последовательности гена 16S рРНК из базы данных SILVA.

Таксономическая структура

Мы проанализировали микробиоту кишечника на уровне сообщества, чтобы определить различия в микробном составе между группами и идентифицировать таксоны со значительно различающейся численностью (относительная численность> 0.001 и P <0,05). Кроме того, для идентификации видов со значительными различиями в численности между тремя группами (| LDA |> 3 и P <0,05) использовался метод линейного дискриминантного анализа (LDA), размер эффекта (LEfSe). U-тесты Краскела-Уоллиса и Манна-Уитни были выполнены для вычисления статистических различий между группами на таксономических уровнях в исследовании, а именно: три основные группы и бесплодная когорта по сравнению с контрольной группой с использованием программного обеспечения STAMP v2.1 (Parks et al., 2014) .

Непрерывные данные представлены как среднее ± стандартное отклонение (SD) или частоты (число и проценты), рассчитанные с использованием статистического программного обеспечения GraphPad Prism 6.0. Чтобы определить статистические различия в характеристиках субъектов между группами, мы выполнили однофакторный дисперсионный анализ с последующим апостериорным тестированием Тьюки.

3. Результаты

3.1 Клинические характеристики среди контрольных групп, групп RIF и UE

Мы включили 31 объект исследования, в том числе 11 фертильных женщин, включенных в контрольную группу, 10 женщин с историей RIF и 10 женщин с история УП (Таблица 1) . Сравнение среднего возраста между тремя группами показало, что контрольная группа была статистически значимо моложе, чем группа RIF (F = 6.8, p <0,01), тогда как группа UE была старше контрольной и моложе группы RIF, хотя оба различия были статистически незначимыми (Таблица 1) . Средний ИМТ не отличался достоверно между контрольной группой и группой UE, а также между группами RIF и UE, но был значимым между контролем и группой RIF (F = 3,7, p <0,05) (Таблица 1) . Среди женщин с РИФ восемь были нерожавшими (80%), двое — нерожавшими (20%), в то время как все женщины с ЯЭ (100%) были первородящими.В группе UE было больше участников-вегетарианцев (9 из 10; 90%), чем в группе RIF (4 из 10; 40%) и контроле (4 из 11; 36%) (Таблица 1) .

3.2 Результаты метагеномики кишечных и вагинальных бактерий

Всего 31 образец фекалий и 24 образца вагинального мазка, секвенирование области V2-V3 гена 16S рРНК дало 235810 последовательностей со средним числом 1,01 767 последовательностей, и 178260 высококачественных последовательностей, в среднем 3,76 012 последовательностей на образец для фекальных и вагинальных образцов соответственно.На основе результатов анализа операционных таксономических единиц (OTU) кривые разрежения показывают, что глубина секвенирования была достаточной для анализа кишечных и вагинальных бактерий в трех группах (Рисунки S1 (a), (b) и Рисунки S2 (a) ), (б)) .

3.3 Богатство и разнообразие кишечных бактерий

Мы провели анализ бактериального разнообразия, сравнив богатство с использованием Chao 1 и равномерность с использованием индекса Шеннона для фекальных микробных сообществ между тремя группами.Мы обнаружили, что богатство значительно различается между тремя группами (индекс Чао 1 (критерий Краскела – Уоллиса, p = 0,049)) (рисунок 1 (a)) . Точнее, контроли имели значительно более высокое содержание, чем группа RIF (pChao 1 = 0,04) и группа UE (pChao 1 = 0,03). Богатство было сходным между группами RIF и UE (pChao 1 = 0,75). Мы обнаружили, что равномерность значительно различалась между тремя группами: индекс Шеннона (критерий Краскела – Уоллиса, p = 0,003) (рисунок 1 (b)) .В частности, контроли имели большую равномерность, чем группы RIF (pShannon = 0,006) и группы UE (pShannon = 0,002). Напротив, ровность была аналогичной между группами RIF и UE (pShannon = 0,65). Интересно, что диета не повлияла на альфа-разнообразие (pShannon = 0,165) (Рисунок 3S) .

Ящичковые диаграммы индексов α-разнообразия кишечных бактериальных микробиомов контрольной (CON, N = 11), RIF (RIF, N = 10) и UE (UE, N = 10) групп: ( а) индексы Шеннона и (б) Чао 1.Значения P были определены с помощью теста Краскела-Уоллиса.

Различия в составе сообщества (β-разнообразие) между контролем (CON, красный, N = 11), RIF (RIF, зеленый, N = 10) и группой UE (UE, голубой N = 10) группы. Сравнения основаны на графиках PCoA расстояний Брея-Кертиса (слева) и Жаккара (справа). Каждая главная координатная ось представляет собой долю отклонения. Непараметрический многомерный дисперсионный анализ (PERMANOVA) использовался для расчета статистических различий между группами.В PCoA на основе Брея-Кертиса первая и вторая оси PCoA составляли 21,5% от общей дисперсии (PERMANOVA, P <0,05, R2 = 0,12). В PCoA на основе Жаккара первая и вторая оси объясняли 23,4% общей дисперсии (PERMANOVA, P <0,05, R2 = 0,10).

Гистограмма показывает сравнение относительной численности таксонов бактерий верхнего кишечника между контрольной (CON, N = 11), RIF (RIF, N = 10) и UE (UE, N = 10) группами в (а) тип (б) семейство и (в) уровни родов.Не было обнаружено различий в относительной численности между уровнями типа и семейства (P> 0,05, критерий Краскела-Уоллиса). Шесть родов бактерий показали статистически значимую (P <0,05, критерий Краскела-Уоллиса) различную численность в трех группах.

Что касается различий в структуре бактериальных сообществ, график PCoA различий Брея-Кертиса и Жаккара показал, что бактерии из групп RIF и UE перекрываются, и что обе группы заметно отличаются от контроля (Рисунки 2 (a), (b) ) .На графике PCoA, основанном на расстояниях Брея-Кертиса, первая и вторая оси PCoA объясняют 21,5% общей дисперсии со значительной разницей (PERMANOVA, P <0,05, R2 = 0,12; , рисунки 2 (a), ). Показывая аналогичный образец кластеризации, на графике PCoA на основе Жаккара первая и вторая оси объясняли 23,4% общей дисперсии со значительной разницей (PERMANOVA, P <0,05, R2 = 0,10; , рисунки 2 (b) ).

3.5 Таксономический анализ кишечных бактерий

После исключения последовательностей, которые присутствовали менее чем в 3%, мы сгруппировали высококачественные последовательности в OTU и присвоили таксономические идентичности.Следовательно, мы обнаружили 550 OTU, относящихся к 481 роду, 265 семействам, 156 порядкам, 68 классам, 715 видам и 28 типам. Чтобы оценить вклад различных таксонов в разнообразие и состав, мы рассчитали относительную численность таксонов на уровне типа, семейства и рода. За исключением уровня родов, мы не смогли найти статистически значимых изменений отдельных таксонов на каких-либо других уровнях. Тем не менее, заметные тенденции с клинической точки зрения все еще были очевидны в данных.

У всех 31 участника состав на уровне филы, представленный процентами считывания, показал обычные структуры микробиоты человека.В целом, среди обнаруженных 28 типов четырьмя наиболее распространенными микробами были Firmicutes (85,10%), Bacteroidetes (7,70%), Proteobacteria (4,75%) и Actinobacteria (1,8%) (рис. а) . При относительной численности менее 1% оставшаяся бактериальная популяция принадлежала к четырем типам, включая Verrucomicrobia, Tenericutes, Cyanobacteria и Chloroflexi .

Firmicutes было больше (7-9%) в группе RIF, чем в контрольной группе и группе UE. Firmicutes были лишь немного больше (2%) в группе UE, чем в контроле. Bacteroidetes были истощены (на 50% меньше) в группе RIF, чем в двух других группах. Напротив, контрольная группа и группа UE имели одинаковые уровни Bacteroidetes. Протеобактерии были относительно менее многочисленны (на 4-7% меньше) в группе RIF, чем в контрольной группе и группе UE (рис. 3 (а)) . Среди трех групп в группе UE были самые высокие уровни Proteobacteria , что почти в 2 раза выше, чем в контроле. Актинобактерии были истощены в группе UE (∼4 раза меньше) по сравнению с двумя другими группами, при этом группа RIF показывала самую высокую численность среди всех групп, с двукратным увеличением численности, чем контрольная группа (Рисунок 3 (a )) .

Доминирующими семействами бактерий для всех субъектов в порядке убывания численности были Lachnospiraceae, Ruminococcaceae, Bifidobacteriaceae, Erysipelotrichaceae, Lactobacillaceae, Prevotellaacae, Vellinollacaea и Enterobacteria (Figure ).Уровни Lachnospiraceae и Ruminococcaceae были одинаковыми в трех группах. Примечательно, что уровни семейств Lactobacillaceae и Prevotellaacae были самыми высокими в контрольной группе по сравнению с двумя другими бесплодными группами. Bacteroidaceae, Vellinollacaea и Enterobacteriaceae были самыми высокими в группе UE по сравнению с RIF и контрольной группами, в то время как семейств Bifidobacteriaceae и Erysipelotrichaceae были самыми высокими в группе RIF по сравнению с группами 9079 и контрольной группой (Рисунок 3). (б)) .

Далее мы определили статистические различия в конкретных бактериальных родах трех групп. Среди 481 рода 6 статистически значимо (p □ <□ 0,05) различались: Bacteroides, Prevotella 9, Hungatella, Ruminococcaceae UCG-004, Ruminococcaceae UCG-010 и Sutterella . За исключением Bacteroides и Prevotella 9 , численность других 5 родов, хотя и была статистически значимой (p □ <□ 0,05), встречалась в гораздо более низких пропорциях (<1%).Примечательно, что Bacteroides и Hungatella были более многочисленными в бесплодной когорте, особенно в группе UE, чем контрольные (Рисунок 3 (c)) .

Bacteroides и Prevotella 9 , два наиболее распространенных рода, значительно различались между тремя группами. По сравнению с контролем относительная численность Prevotella 9 заметно снизилась в группе RIF (в 7 раз) и группе UE (в 8 раз), а относительная численность Bacteroides выросла в группе RIF (1.5 раз) и группа UE (3,2 раза) (Рисунок 3 (c)) . Когда мы сравнивали бесплодную группу с контрольной, мы обнаружили, что в бесплодной когорте Prevotella 9, Ruminococcaceae UCG-004, Ruminococcaceae UCG-010 (p □ <□ 0,05) снизились, тогда как Bacteroides, Dorea, оральный клон FR58 и Peptoniphilus увеличилось (p □ <□ 0,05) (Рисунок 4S) .